R不能根据公式生成倾向得分;没有错误也没有计算
我想在多次插补后做倾向评分,但我认为R是错误的,尽管没有显示错误 加载包“cobalt”时,有一个合并的数据集:lalonde_mis,我们将在本例中使用它 多重插补数据如下:R不能根据公式生成倾向得分;没有错误也没有计算,r,R,我想在多次插补后做倾向评分,但我认为R是错误的,尽管没有显示错误 加载包“cobalt”时,有一个合并的数据集:lalonde_mis,我们将在本例中使用它 多重插补数据如下: library(mice) library(cobalt) library(MatchIt) data(lalonde_mis) m <- 10 imp <- mice(lalonde_mis, m = m, print = FALSE) imp.data <- complete(imp, "lo
library(mice)
library(cobalt)
library(MatchIt)
data(lalonde_mis)
m <- 10
imp <- mice(lalonde_mis, m = m, print = FALSE)
imp.data <- complete(imp, "long", include = FALSE)
imp.data <- imp.data[with(imp.data, order(.imp, .id)),]
问题是
鼠标
将其complete()
输出中因子
的imp
变量类型更改为数值
。因此,它没有级别,levels(imp.data$.imp)
返回NULL
,因此循环永远不会运行。将级别
替换为唯一
,这将修复错误。我将在下一版本中更新cobalt
vignette以反映这一点。我无法复制您的问题str(imp.data)
给了我例如$ps:num 0.6562 0.0414 0.2416 0.7396 0.7448…
你使用的是什么版本的R/RStudio,可能是问题所在?我有3.4.3。您应该在问题中报告您的sessionInfo()
。如果是R版本导致了这个问题,我会感到惊讶。我也尝试过Rstudio和其他R版本,但它不起作用;甚至尝试重新安装这两个程序。在原始帖子中编辑了sessionInfo()!sessionInfo()与您的有很大不同吗?无法使用R版本3.3.2(2016-10-31)
、MatchIt_3.0.1
、cobalt_2.1.0
和mice_2.30
imp.data$ps <- imp.data$match.weight <- rep(0, nrow(imp.data))
for (i in levels(imp.data$.imp)) {
in.imp <- imp.data$.imp == i
imp.data$ps[in.imp] <- glm(treat ~ age + educ + race +
married + nodegree +
re74 + re75,
data = imp.data[in.imp,],
family = "binomial")$fitted.values
m.out <- matchit(treat ~ ps, data = imp.data[in.imp,],
distance = imp.data$ps[in.imp])
imp.data$match.weight[in.imp] <- m.out$weights
}
imp.data$ps <- imp.data$match.weight <- rep(0, nrow(imp.data))
for (i in levels(imp.data$.imp)) {
in.imp <- imp.data$.imp == i
imp.data$ps[in.imp] <- glm(treat ~ age + educ + race +
married + nodegree +
re74 + re75,
data = imp.data[in.imp,],
family = "binomial")$fitted.values}
R version 3.4.4 (2018-03-15)
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base