Singularity container 奇点沙盒文件管理_Singularity Container

Singularity container 奇点沙盒文件管理

Singularity container 奇点沙盒文件管理,singularity-container,Singularity Container,受够了与lib安装/依赖问题的斗争，我开始使用Singularity。尽管如此，我不确定自己是否确切地理解了它在沙箱模式下的文件管理（而不是数据、程序）是如何工作的。例如，我设计了一个非常简单的定义文件，它只是一个“裸”Debian：我创建了一个沙盒，其中包含以下内容： sudo singularity build --sandbox Test/ naked_Debian.def 我试着安装一个程序。但我不明白的是，我成功地做到了，删除了沙盒目录，但我认为仍然有在沙盒生命周期中创建的文件

受够了与lib安装/依赖问题的斗争，我开始使用Singularity。尽管如此，我不确定自己是否确切地理解了它在沙箱模式下的文件管理（而不是数据、程序）是如何工作的。例如，我设计了一个非常简单的定义文件，它只是一个“裸”Debian：

我创建了一个沙盒，其中包含以下内容：

sudo singularity build --sandbox Test/ naked_Debian.def

我试着安装一个程序。但我不明白的是，我成功地做到了，删除了沙盒目录，但我认为仍然有在沙盒生命周期中创建的文件（在/dev、/run、/root等中）。例如，我从git克隆的程序现在位于本地的/root中（独立于任何容器）。据我所知，所有东西都在容器中，如果我删除沙盒目录，它们就会消失。否则，我会把所有的测试都搞得一团糟？然后我无法将容器从一个系统移植到另一个系统

如果我创建任何新的沙盒目录，程序已经存在

干杯，

Mathieu

默认情况下，singularity将

$HOME

装载到容器中，并将该路径用作

singularity shell/exec

的工作目录。由于您正在使用sudo运行沙箱，

/root

正在装载，如果您没有

cd

到其他目录，那么您克隆的任何repo都会在这里结束<代码>/tmp也会自动装入，但这不太可能导致问题，因为它只是临时文件

您有几个选项可以避免文件最终出现在您不希望出现的地方

禁用主页自动装载：

singularity shell--没有主页…

默认的工作目录现在是
```
/
```
，而不是
```
$HOME
```
，文件直接在沙箱中创建（与装入目录相反）
如果要从沙箱中取出文件，则需要将文件从容器中复制到
```
/tmp
```
，并在主机操作系统上从
```
/tmp
```
复制到所需位置

设置一个不同的位置用作主页：

singularity shell--home$PWD…

这将装入并使用当前目录作为主机操作系统上用户的
```
$HOME
```
，而不是用户的
```
$HOME
```
在主机操作系统和容器之间移动文件更简单，但仍然在主机操作系统中创建文件

根本不挂载系统目录：

singularity shell--contain--workdir/some/dir…

```
/tmp
```
和
```
/var/tmp
```
的目录是在
```
/some/dir
```
中创建的，而不是在主机上使用
```
/tmp
```
和
```
/var/tmp
```
```
$HOME
```
与主机具有相同的路径，并用作工作目录，但它为空且与主机操作系统分离
与主机操作系统完全分离，同时仍允许在容器和操作系统之间进行一些访问

有关这些选项的其他详细信息。