Unix 为行合并文件行错误

我有两个相同长度的文件，我想每行合并一行。以下是我的文件，例如：

FileA.txt

DM  CM127861    chr14   103390285   +   NM_030943   AMN Megaloblasticanaemia1   
DM  CM118934    chr14   103395855   +   NM_030943   AMN Megaloblasticanaemia1   
DM  CM127864    chr14   103395992   +   NM_030943   AMN Megaloblasticanaemia1   
DM  CM088131    chr14   103395814   +   NM_030943   AMN Megaloblasticanaemia1   
DM  CM124403    chr14   103395776   +   NM_030943   AMN Imerslund-Gr‰sbecksyndrome
DM  CM002932    chr1    115220593   -   NM_000036   AMPD1   Adenosinemonophosphatedeaminasedeficiency
    etc

FileB.txt

TGT    C    TAT    Y
ATG    M    AAG    K
CAG    Q    GAG    E
CCG    P    TCG    S
CCG    P    CTG    L
GCG    A    GTG    V

我希望我的最终输出是：

DM  CM127861    chr14   103390285   +   NM_030943   AMN Megaloblasticanaemia1    TGT    C   TAT    Y
etc

为了做到这一点，我一直在使用这个粘贴命令：

paste-d'\t'FileA.txt FileB.txt>combined.txt

，但是，我不断地收到这个错误

读取FileA.txt时出错。我很确定这与我的
%
符号有关。我试图将文件中的所有%更改为另一个字符，但它遇到了另一个无法处理的字符。我很确定它会在我的整个文件中不断遇到这些错误，因为它有一些不寻常的字符。当出现一些不寻常的字符时，是否有其他方法逐行合并文件

ls-l用于以下两个文件：

-rw-r--@1 christy staff 4811597 Aug 27 14:18 Translated.txt

-rw-r--r--1 christy staff 846004 Aug 27 14:18 Translated2.txt
有些事你没有告诉我们。例如，这样做没有问题：

$ paste FileA.txt FileB.txt
Syndrome    ATG Y
Syndrome%    AGT        K

如果您得到一个“读取FileA.txt时出错”，则更多地表明该文件可能不存在或您没有读取权限。什么是

ls -l *.txt

说什么？您是否碰巧不知道Unix在文件名中区分大小写

编辑：可能与扩展属性相关。你可以把它们列在一起

$ xattr -l FileA.txt

或

由于根据医生的姓名判断，文件中的“有趣”字符应该是a-umlaut，如Imerslund Gräsbeck中所述，因此可能与编码有关。如果
ls-l@
显示类似
com.apple.textcodencing
的内容，请尝试使用删除该属性

$ xattr -d com.apple.TextEncoding FileA.txt

如果出现其他属性，如
com.apple.quantial
，请同时删除它们。
我无法根据问题中包含的数据复制您遇到的问题，因此。。。这里有一个基于awk的选项，可以替代
粘贴

awk '{getline B < "fileB.txt"; print $0 "\t" B;}' fileA.txt > combined.txt

因为它不需要将所有一个文件加载到内存中。当然，如果您有足够的内存，一次读取一个文件可能比逐行读取每个文件运行得更快。如果成功，结果应该是相同的。
您能尝试查找更多信息吗<代码>ls-l

如@Jens所建议

cat FileA.txt FileB.txt

查看问题是否是特定于粘贴的，

paste-d'\t'FileB.txt FileB.txt

查看问题是否是特定于FileA.txt的。@WalterA我用

ls-l

更新了我的帖子，

cat

工作正常。当我在复制的文件上尝试你的命令时，我没有看到错误，粘贴成功。您的问题中是否有可能包含足够的原材料，以使问题得以复制？可能Translated.txt较短或具有一些非常特殊的字符。使用较小子集的调试的

wc-l Translated*.txt

检查长度：

head-10 Translated.txt>a；head-10 Translated2.txt>b；粘贴-d'\t'a b

。当这起作用时，尝试更多行（1005003000），直到您知道问题出在哪里：

while[1]；一定要读nr_行；head-${nr_lines}Translated.txt>a；head-${nr_lines}Translated2.txt>b；粘贴-d'\t'a b|tail-5；完成

这是在配备IOS的Apple上完成的吗？文件名绝对不区分大小写，因为它将输出文件，最多可输出指定字符，但随后将停止合并。当我删除我认为导致问题的字符时，它会合并更多的行，直到它碰到另一个导致问题的字符。我的文件有点复杂，所以我没有发布我文件的精确摘录，但也许我应该这么做。我已经用我的博客上的一个确切例子更新了我的帖子file@christylynn002ls输出中的

@

是什么意思？

manls

描述了它的解释吗？@christylynn002我做了一些研究；

@

表示可使用

ls-le*.txt

列出的扩展属性。另一个猜测是：您的磁盘空间是否用完了？这一操作非常有效。我不知道为什么我不能让浆糊起作用。谢谢你。现在我没有陷入困境：）

awk '{getline B < "fileB.txt"; print $0 "\t" B;}' fileA.txt > combined.txt

awk 'NR==FNR{a[NR]=$0;next;} {print $0 "\t" a[FNR];}' fileB.txt fileA.txt