Unix 使用sed删除'&燃气轮机'；加上索引号和字符串？

我知道这应该很简单，但我不能让它工作。我的文件看起来像这样

>c12345|random info goes here that I want to delete
AAAAATTTTTTTTCCCC
>c45678| more | random info|  here
GGGGGGGGGGG

我想做的就是让它变得更简单，看起来像这样

>seq1 [organism=human]
AAAAATTTTTTTTCCCC
>seq2 [organism=human]
GGGGGGGGGGGG
>seq3 [organism=human]
etc....

我知道，一旦我通过以下操作获得索引部分，我就可以轻松地附加该常量：

sed '/^>/ s/$/\[organism-human]/g'

---

但是如何建立索引呢？

这里有一种方法可以使用awk实现：

$ awk '/^>/ { $0 = ">seq" ++i " [organism=human]" } 1' file
>seq1 [organism=human]
AAAAATTTTTTTTCCCC
>seq2 [organism=human]
GGGGGGGGGGG

---

当该行以

开头时，将其替换为

seq

，然后是

i

（每次增加1），然后是

[生物体=人类]

。命令末尾的

1

为true，因此awk执行默认操作，即打印行。

以下是使用awk执行此操作的一种方法：

$ awk '/^>/ { $0 = ">seq" ++i " [organism=human]" } 1' file
>seq1 [organism=human]
AAAAATTTTTTTTCCCC
>seq2 [organism=human]
GGGGGGGGGGG

当该行以

开头时，将其替换为

seq

，然后是

i

（每次增加1），然后是

[生物体=人类]

。命令末尾的

1

为true，因此awk执行默认操作，即打印行。

使用sed：

sed '/^>/d' filename | sed '=' | sed 's/^[0-9]*$/>seq& [organism=human]/'

（感谢NeronLeVelu的简化。）

使用sed：

sed '/^>/d' filename | sed '=' | sed 's/^[0-9]*$/>seq& [organism=human]/'

---

（感谢NeronLeVelu的简化。）

使用Perl one liner可能更容易：

perl -ne 'chomp; if (/^>/) { s/\|.*$//; print "$_ \[organism=human\]\n";} else { print "$_\n";}' filename

---

使用Perl一行程序可能更容易：

perl -ne 'chomp; if (/^>/) { s/\|.*$//; print "$_ \[organism=human\]\n";} else { print "$_\n";}' filename

---

最后一个sed的命题可以是

sed的/^[0-9]\{1，\}$/>seq&[organic=human]/'

假设第二行始终包含letter@NeronLeVelu：你说得对，我的

N

很脆弱，不必要的过度杀伤力。但我想我实际上可以让它比你的提议简单一点……最后一个sed的提议可以是

sed的/^[0-9]\{1，\}$/>seq&[organic=human]/'

假设第二行总是包含letter@NeronLeVelu：你说得对，我的

N

很脆弱，不必要的过度杀伤力。但我想我可以让它比你的建议简单一点。。。