Bash 复制粘贴代码可以工作，但不能作为脚本

我编写了一个脚本，其中包含六条if语句，如下所示：

#!/usr/bin/bash
if [ -n $var1 ]
        then
            for f in /path/*.fastq.gz
            do
                x=${f/%.fastq.gz/_sample1-forward.fastq.gz}
                y=${f/%.fastq.gz/_sample1-forward.out}
                q=${f/%.fastq.gz/_temp.fastq.gz}
                command [options] -i $f -o $temp${x##*/} 
                cp $temp${x##*/} $temp${q##*/}
            done
        else
            echo "no $var1"
            for f in /path/*.fastq.gz
            do
                q=${f/%.fastq.gz/_temp.fastq.gz}
                cp $f $temp${q##*/}
            done
fi

其他五条语句对var2到var6执行类似的任务。当我运行脚本时，我得到了意外的输出（没有错误，没有警告），但是当我将每个if语句复制粘贴到终端时，我得到了我期望的确切结果。我已经寻找隐藏字符或语法问题好几个小时了。这可能是一个空壳问题吗？在OSX上编写脚本（默认zsh）并在服务器上执行（默认bash）。我有一种类似的感觉，但我在回复中找不到我的问题的答案

欢迎提出任何意见

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Niwatori

你也许应该看看shebang。我认为正确的用法应该是

#/usr/bin/env bash

或

#/bin/bash

谢谢您的帮助，非常感谢。谢邦似乎不是问题所在，不过谢谢你指出这一点。Shellcheck.net提醒我使用

[[]

对于不带引号的变量，但这也不能解决问题。以下是出现的问题以及我如何“修复”它：

对于每个变量，使用相同的命令（工具），该命令依赖于支持文件（格式相似但内容不同）。最初，在每个if语句之前，我用当前变量所需的支持文件替换了前一个变量的支持文件。出于某种原因（奇怪的原因，任何想法都是受欢迎的），这种情况并不总是正确发生的。 作为一种快速解决方法，我制作了六个版本的工具，所有版本都有不同的支持文件，并在每个if语句之前使用PYTHONPATH=/path/to/version/：$PYTHONPATH。最佳做法是调整该工具，以便它可以使用不同的支持文件或处理重复任务的选项，但我目前没有时间

祝你今天愉快，

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Niwatori

请首先在粘贴您的脚本，并尝试执行此处提出的建议。