从R语言调用的C函数中的动态内存分配
我正在编写一个调用C脚本的R包。C脚本使用具有动态确定长度的结构:数组从R语言调用的C函数中的动态内存分配,c,r,memory,memory-management,C,R,Memory,Memory Management,我正在编写一个调用C脚本的R包。C脚本使用具有动态确定长度的结构:数组林->边的长度取决于从R传递的数据 typedef struct { unsigned int n_edge; ... unsigned int max_node; unsigned int edges[]; } forest; forest * forest_new (unsigned int *n_edge) { forest *f = malloc(sizeof(forest) + (2 * *n_
林->边的长度取决于从R传递的数据
typedef struct {
unsigned int n_edge;
...
unsigned int max_node;
unsigned int edges[];
} forest;
forest * forest_new (unsigned int *n_edge) {
forest *f = malloc(sizeof(forest) + (2 * *n_edge * sizeof(int)));
f->n_edge = *n_edge;
...
f->max_node = 0;
return f;
}
代码在C中成功运行,但在R调用触发forest\u new
时崩溃。我的直觉是,崩溃是由内存分配造成的,事实上,它提到了分配内存的替代方法(例如R\u alloc
,Calloc
),这似乎表明应该使用malloc
/Calloc
)
因此,问题的第1部分是何时应该或必须用R-safe等价物替换对malloc
/calloc
的调用(也许它们与我的问题无关?)。
问题的第2部分是R-safe函数如何处理长度动态确定的结构。您可以在包中使用malloc/calloc
和free
来分配和释放内存,但您必须像在任何C应用程序中一样处理内存不足错误。您可以使用R提供的Calloc/Free/Realloc
,然后以“R方式”(内存不足时的R错误)处理错误。R\u alloc
函数允许您分配临时数据,这些数据在外部函数退出时自动释放(当您返回到R时,它是基于堆栈的分配)
R不关心您的C代码是否使用具有动态确定长度的结构(灵活的数组),R根本不访问您的结构
如果您需要更多帮助,请发布一个自包含的示例或提供有关错误的更多信息。也许还值得检查n\u edge
在forest\u new
中是否有正确/正常的值