Fortran 写入/dev/null时记录结束
在我们的数字软件中,我在升级集群后遇到了一个奇怪的错误。 即:Fortran 写入/dev/null时记录结束,fortran,gfortran,openmpi,dev-null,Fortran,Gfortran,Openmpi,Dev Null,在我们的数字软件中,我在升级集群后遇到了一个奇怪的错误。 即: At line 501 of file /home/weser/code/neci/src/fcimc_helper.F90 (unit = 6, file = '/dev/null') Fortran runtime error: End of record 在这一行中有一个打印到stdout的print*,语句 在我们的程序中,关闭并重新打开所有非根MPI进程的标准输出,以写入/dev/null。 (除调试模式外,每个非根MP
At line 501 of file /home/weser/code/neci/src/fcimc_helper.F90 (unit = 6, file = '/dev/null')
Fortran runtime error: End of record
在这一行中有一个打印到stdout的print*,
语句
在我们的程序中,关闭并重新打开所有非根MPI进程的标准输出,以写入/dev/null
。
(除调试模式外,每个非根MPI进程的标准输出将重定向到单独的文件。)
我试图为这个问题创建一个最小的示例,如下所示:
program stdout_to_dev_null
use iso_fortran_env, only: stdout => output_unit
use mpi_f08 ! also works with plain mpi
implicit none(type, external)
integer :: rank, n_procs, ierror
integer, parameter :: root = 0
call MPI_INIT(ierror)
call MPI_COMM_SIZE(MPI_COMM_WORLD, n_procs, ierror)
call MPI_COMM_RANK(MPI_COMM_WORLD, rank, ierror)
if (rank /= root) then
close(stdout, status="keep")
open(stdout, file="/dev/null", recl=8192)
end if
write(stdout, *) 'Size is ', n_procs
write(stdout, *) 'node', rank, ': Hello world'
block
integer :: i
character(:), allocatable :: large_string
allocate(character(len=5000) :: large_string)
do i = 1, len(large_string)
large_string(i : i) = 'A'
end do
write(stdout, *) large_string
end block
call MPI_FINALIZE(ierror)
end program
问题是,当使用mpirun
手动运行时,这个最小的示例完全按照预期工作,但当实际发送到集群时,就像其他繁重的计算一样
现在我有三个问题:在这样的代码中,当关闭和重新打开STDOUT时,我是否有未定义的行为,而在最简单的示例中,我只是很幸运?如何在
/dev/null
中有记录结尾?如何正确解决此问题?此问题与MPI无关,也与集群中的差异无关。ª
这是一个有问题的代码,它在gfortran
中失败,但在ifort
下工作纯属运气
如果以固定记录长度(recl=…
)打开文件,则write语句不得超过此长度,即使输出转到/dev/null
。
修复方法就是不使用固定的记录长度打开,并省略recl=…
参数
显然,ifort
的运行时库更为宽松,甚至在写入对象的字节长度大于open
语句中指定的记录长度时也能工作
在下面的示例中,最后一个write
语句在gfortran
下失败
program stdout_to_dev_null
use iso_fortran_env, only: stdout => output_unit
implicit none(type, external)
integer, parameter :: rec_length = 10
write(stdout, *) 'asdf'
close(stdout, status="keep")
open(stdout, file="/dev/null")
block
integer :: i
character(:), allocatable :: large_string
allocate(character(len=rec_length - 1) :: large_string)
do i = 1, len(large_string)
large_string(i : i) = 'A'
end do
write(stdout, *) large_string
deallocate(large_string)
allocate(character(len=rec_length + 1) :: large_string)
do i = 1, len(large_string)
large_string(i : i) = 'A'
end do
write(stdout, *) large_string
end block
close(stdout, status="keep")
open(stdout, file="/dev/null", recl=rec_length)
block
integer :: i
character(:), allocatable :: large_string
allocate(character(len=rec_length - 1) :: large_string)
do i = 1, len(large_string)
large_string(i : i) = 'A'
end do
write(stdout, *) large_string
deallocate(large_string)
allocate(character(len=rec_length + 1) :: large_string)
do i = 1, len(large_string)
large_string(i : i) = 'A'
end do
! The following statement fails
write(stdout, *) large_string
end block
close(stdout, status="keep")
end program
对于这个问题,新旧集群之间的相关区别在于,我们在新集群上使用
gfortran+OpenMPI
,在旧集群上使用ifort+IntelMPI