Graph 旋回和复杂旋回。如何在图表中找到它们？

我有一个cif格式的分子。我不认为格式真的很重要，但是为那些感兴趣的人提供它。这个文件里面有很多数据。最重要的是（文件的这一部分实际上以图形的形式描述了分子）这一部分：

017 N1  C2   SING N N 1  
017 N1  H11  SING N N 2  
017 N1  H12  SING N N 3  
017 C2  C3   DOUB Y N 4  
017 C2  C7   SING Y N 5  
017 C3  C4   SING Y N 6

这不是整个文件，只是一个示例。这种分子可能含有许多环状结构。芳香族，我可以用6列中的Y标志来定义。但也有其他的周期，它们可以是完全不同的：或者像那样或那样：。甚至是这样的：

我需要的是以这样的方式提取所有的循环，如果两个循环共享键，就像在第一个例子中，它们被认为是一个循环。Tarjan的算法在这里不起作用，因为每个节点只运行一次。那我该怎么做呢？

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请提供尽可能详细的信息。我对诸如OpenBabel之类的库不太感兴趣，因为我将用Swift编写这个东西，并使用cif文件中的图形描述。

对于您的第一个图表，您是否只想输出一个循环（由外圈组成）？我真正想要的是找到所有的循环并重新编写这样的cif文件，假设C2和C3是环成员，在这种情况下：

017n1 C2R SING N 1 017n1 H11 SING N 2 017n1 H12 SING N 3 017c2r C3R DOUB Y N 4 017c2r C7 SING Y N 5 017 C3R C4 SING Y N 6

，也让C7是不同环的成员，在这种情况下，我重写文件如下：

017n1 C2R1 SING N N 1 017n1 H11 SING N 2 017n1 H12 SING N 3 017c2r1 C3R1 DOUB Y N 4 017 C2R1 C7R2 SING Y N 5 017 C3R1 C4 SING Y N 6

或在单独的列中。是的，我希望它被视为一个结构。结构1的所有原子应命名为atomNameR1。我希望这个结构也一样：看起来它可能有用。之后，我认为可以对循环集进行划分，这样如果两个循环共享一条边，它们就在同一个子集中。我不确定最好的方法是什么。@KlausWarzecha我从PDB CIF文件中获取了以下数据：