Hdf5 属性错误：'；数据集'；对象没有属性'；价值'；

我在使用程序包读取hdf5文件时遇到此错误：

dataset.value

错误：

Traceback (most recent call last):
  File "train.py", line 163, in <module>
    train(0, False, args.gpu_list, args.model_path)
  File "train.py", line 76, in train
    dataset = Ani1Dataset(dir_path='/data/ANI-1_release')
  File "/code/ani1dataset.py", line 16, in __init__
    self.parse(dir_path)
  File "/code/ani1dataset.py", line 32, in parse
    for molecule in adl:
  File "/code/pyanitools.py", line 75, in __iter__
    for data in self.h5py_dataset_iterator(self.store):
  File "/code/pyanitools.py", line 71, in h5py_dataset_iterator
    yield from self.h5py_dataset_iterator(item, path)
  File "/code/pyanitools.py", line 60, in h5py_dataset_iterator
    dataset = np.array(item[k].value)
AttributeError: 'Dataset' object has no attribute 'value'

回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“train.py”，第163行，在
列车（0，错误，args.gpu\u列表，args.model\u路径）
列车中第76行的文件“train.py”
dataset=Ani1Dataset（目录路径='/data/ANI-1\u发布'）
文件“/code/ani1dataset.py”，第16行，在__
self.parse（dir\u路径）
文件“/code/ani1dataset.py”，第32行，在parse中
对于adl中的分子：
文件“/code/pyanitools.py”，第75行，在__
对于self.h5py_数据集_迭代器（self.store）中的数据：
h5py_数据集迭代器中的文件“/code/pyanitools.py”，第71行
从self.h5py_数据集_迭代器（项，路径）生成
h5py_数据集_迭代器中的文件“/code/pyanitools.py”，第60行
dataset=np.array（项[k].值）
AttributeError:“数据集”对象没有属性“值”

已弃用dataset.value属性。或使用：

dataset[()]

或降级

h5py

以使用旧语法：

pip3 install --upgrade pip && pip3 install h5py=='2.9.0'

---

是的，

.value

已被弃用一段时间。正如我在上面的评论中提到的，如果没有令人信服的理由，我不会降级到h5py 2.9.0。它于2014年发布。当前的h5py版本为3.2，支持最新的HDF5格式，并具有许多增强功能和错误更正功能

使用h5py访问HDF5数据有两种主要方式。简而言之，您可以：

返回一个h5py数据集对象。dataset对象的行为“就像”它是一个数组，但在需要之前不会将数据加载到内存中

返回一个NumPy数组。这会立即将数据加载到内存中

以下各示例：

with h5py.File('filename.h5','r') as h5f:
    # return a h5py dataset object:
    my_ds_obj = h5f[ds_name]
    # return a h5py dataset object:
    my_ds_arr = h5f[ds_name][:]

---

此外，如果您只想读取一些数据，h5py支持大多数NumPy切片语法，包括花式索引的子集

在上面的代码中，如果

item[k]

引用HDF5数据集，则可以使用

dataset=item[k][：]

将其读入NumPy数组。干净多了。此外，如果没有令人信服的理由，我不会降级到h5py 2.9.0。它于2014年发布。当前的h5py版本为3.2，支持较新的HDF5格式，并具有许多增强功能和错误更正功能。