为什么rJava不能在使用OpenJDK 7的Ubuntu14.04上工作？

嗨，我对cran的rJava软件包有问题

我已经安装了

sudo apt-get install openjdk-7-jdk
sudo apt-get install r-cran-rjava

然后跑

sudo R CMD javareconf
# Java interpreter : /usr/bin/java
# Java version     : 1.7.0_55
# Java home path   : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre
# Java compiler    : /usr/bin/javac
# Java headers gen.: /usr/bin/javah
# Java archive tool: /usr/bin/jar

然后，我尝试运行R并加载rJava，并得到以下错误：

R
> library(rJava)
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/usr/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’

我使用的是Ubuntu 14.04 64位，我使用的是R版本3.1.0（2014-04-10）-“春舞”

更新：实际上这不是OpenJDK特有的，我只是尝试了oracle java 8，得到了相同的结果。我还发现了这个我不愿意使用的变通方法，因为它确实是一个变通方法，并没有真正解释为什么它是必要的。在我看来，包装系统应该处理好这一点。看起来像是libjvm。问题就在这里

/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/jamvm/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-oracle/jre/lib/amd64/server/libjvm.so

由于某些原因，rJava无法找到它们，尽管使用sudo R CMD javareconf进行了更新

更新2：绘图变厚：如果我像sudo那样运行R，它就会工作

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感谢指针。

对于类似的配置（R3.1.0、Ubuntu 12.10、32位），我也遇到了同样的问题。我发现答案在于正确设置LD_LIBRARY_路径，如下所述： 除了所讨论的子目录是“客户机”而不是“服务器”。因此，现在我将我的环境设置为：

export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386
export LD_LIBRARY_PATH=$JAVA_HOME/jre/lib/i386:$JAVA_HOME/jre/lib/i386/client

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我能够用这个答案永久地解决这个问题：

如果您安装了OracleJava7或8，这是非常有用的。在我的例子中，导出变量并不是一个永久的解决方案。您应该通过执行以下操作来检查R正在使用什么作为环境：

Sys.getenv("JAVA_HOME")

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然后，您可以通过在/etc/ld.so.conf.d/上创建一个

java.conf

文件来使用该环境。

您可以通过像超级用户一样打开rstudio来解决这个问题

sudo rstudio

然后在里边跑

install.packages('rJava')

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如果您使用的是oracle java，请使用以下命令：

sudo R CMD javareconf

不会帮助使用：

sudo R CMD javareconf **JAVA_HOME**=(path where java home is located)

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我尝试了很多事情，但都没有成功。然后我试着用

sudo rstudio

然后

install.packages('rJava')

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它起作用了。Coool

在Ubuntu上安装rJava软件包并不像大多数其他R软件包那样简单。一些关于如何做的快速说明（来源：）

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这确实解决了我一直面临的问题。剩下的唯一问题是为什么LD_LIBRARY_PATH没有自动设置？但不管怎样，就像我说的，这解决了我的问题。谢谢。在ubuntu服务器14.04上为我工作

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/：/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server

更简单的解决方案，它也为我工作。只有“type…”不是终端命令，因此应采用不同的格式。谢谢。如果你使用RStudio服务器，命令sudo RStudio doesn不适用，也可以在这里找到-这对我来说很有效，但在安装rJava之前，我必须在终端中执行“sudo R CMD javareconf”。

Install the Java Runtime Environment (JRE).

sudo apt-get install -y default-jre

Install the Java Development Kit (JDK).

sudo apt-get install -y default-jdk

Update where R expects to find various Java files.

sudo R CMD javareconf

Install the package.

> install.packages("rJava")

If you have a RStudio session open, then exit and restart it. This is important (a running RStudio session will not pick up these changes!).