Java 谷歌差异匹配补丁不'；我不能在某些文件上正常工作

我正在使用google diff match补丁与文本文件进行比较。第一个输入是xml文件，第二个输入是xml文件，首先我规范化了两个文件的文本。它适用于许多文件，但在某些文件上工作不正常，这表明这两个文件完全不同。但事实并非如此。我的代码是：

package com.java.contentMatcher;
import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.IOException;
import java.util.Iterator;
import java.util.LinkedList;
import java.util.Properties;
import java.util.Scanner;
import org.apache.commons.io.FileUtils;
import org.apache.commons.io.FilenameUtils;
import org.apache.commons.io.filefilter.TrueFileFilter;
import com.java.diff.diff_match_patch;
import com.java.diff.diff_match_patch.Diff;
import com.java.diff.diff_match_patch.Operation;
public class SGL_ContentMatcher {
public static Properties CONFIG_PROPS;
public static String input_path1, input_path2, compaired_file;
public static String text1 = "";
public static void main(String[] args) throws IOException {

    Scanner scanIn = new Scanner(System.in);
    System.out.println("Enter  Html Input Directory : ");
    input_path1 = scanIn.nextLine();

    System.out.println("Enter  XML Input Directory : ");
    input_path2 = scanIn.nextLine();

    System.out.println("Enter  Output Directory : ");
    compaired_file = scanIn.nextLine();
    LinkedList<File> input_list = (LinkedList<File>) FileUtils.listFiles(new File(input_path1),
            TrueFileFilter.INSTANCE, TrueFileFilter.INSTANCE);
    LinkedList<File> output_list = (LinkedList<File>) FileUtils.listFiles(new File(input_path2),
            TrueFileFilter.INSTANCE, TrueFileFilter.INSTANCE);
    for (Iterator iterator = input_list.iterator(); iterator.hasNext();) {
        File file = (File) iterator.next();

        for (Iterator iterator2 = output_list.iterator(); iterator2.hasNext();) {
            File file2 = (File) iterator2.next();

            String f1 = FilenameUtils.getExtension(file.getName());
            String f2 = FilenameUtils.getExtension(file2.getName());

            if (f1.equals("html") && f2.equals("xml")) {
                String filename1, filename2;

                int end = file.getName().lastIndexOf(FilenameUtils.getExtension(file.getName()));
                filename1 = file.getName().substring(0, end);

                end = file2.getName().lastIndexOf(FilenameUtils.getExtension(file2.getName()));
                filename2 = file2.getName().substring(0, end);
                System.out.println(filename1 + "---------------" + filename2);

                if (filename1.equals(filename2)) {

                    System.out.println("file1" + file.getName() + "File2" + file2.getName());
                    // first file
                    xmlInput = xmlInput.replaceAll("\\n+|\\r+|\\t+", " ").replaceAll("<.*?>", " ")
                            .replaceAll("&#[a-zA-Z0-9]+;", " ").replaceAll("&[a-zA-Z0-9]+;", " ")
                            .replaceAll("\\s+", " ");

                    String xmlInput2 = FileUtils.readFileToString(file2);

                    xmlInput2 = xmlInput2.replaceAll("\\n+|\\r+|\\t+", " ").replaceAll("<.*?>", " ")
                            .replaceAll("&#[a-zA-Z0-9]+;", " ").replaceAll("&[a-zA-Z0-9]+;", " ")
                            .replaceAll("\\s+", " ");

                    diff_match_patch diff = new diff_match_patch();
                    LinkedList<Diff> diffrences = diff.diff_main(xmlInput, xmlInput2);
                    String str = diff.diff_prettyHtml(diffrences);

                    FileUtils.writeStringToFile(new File(compaired_file + File.separator + file.getName()), str);

                    // String text1 = "";
                    String text2 = "";
                    String text3 = "";
                    for (Diff d : diffrences) {
                        if (d.operation == Operation.DELETE) {
                            text1 = text1 + " " + d.text;

                            System.err.println("text1" + text1 + "text2" + text2);
                        } else if (d.operation == Operation.INSERT) {
                            text2 = text2 + " " + d.text;
                            // System.err.println("text1"+text1+"text2"+text2);
                        } else if (d.operation == Operation.EQUAL) {
                            text3 = text3 + " " + d.text;
                        }

                    }
                   text1 = text1 + " ---->" + file2.getName();
                }
            }
        }
    }
    FileUtils.writeStringToFile(new File(compaired_file + "/UnMatched.txt"), text1);
}

}

package com.java.contentMatcher；
导入java.io.File；
导入java.io.FileInputStream；
导入java.io.IOException；
导入java.util.Iterator；
导入java.util.LinkedList；
导入java.util.Properties；
导入java.util.Scanner；
导入org.apache.commons.io.FileUtils；
导入org.apache.commons.io.FilenameUtils；
导入org.apache.commons.io.filefilter.TrueFileFilter；
导入com.java.diff.diff_匹配_补丁；
导入com.java.diff.diff_match_patch.diff；
导入com.java.diff.diff_match_patch.Operation；
公共类SGL_内容匹配器{
公共静态属性配置道具；
公共静态字符串输入路径1、输入路径2、比较文件；
公共静态字符串text1=“”；
公共静态void main（字符串[]args）引发IOException{
Scanner scanIn=新扫描仪（System.in）；
System.out.println（“输入Html输入目录：”）；
input_path1=scanIn.nextLine（）；
System.out.println（“输入XML输入目录：”）；
input_path2=scanIn.nextLine（）；
System.out.println（“输入输出目录：”）；
compaired_file=scanIn.nextLine（）；
LinkedList输入\列表=（LinkedList）FileUtils.listFiles（新文件（输入\路径1），
TrueFileFilter.INSTANCE，TrueFileFilter.INSTANCE）；
LinkedList输出\列表=（LinkedList）FileUtils.listFiles（新文件（输入\路径2），
TrueFileFilter.INSTANCE，TrueFileFilter.INSTANCE）；
for（Iterator Iterator=input_list.Iterator（）；Iterator.hasNext（）；）{
File=（File）iterator.next（）；
for（迭代器迭代器2=output_list.Iterator（）；迭代器2.hasNext（）；）{
File file2=（File）iterator2.next（）；
字符串f1=FilenameUtils.getExtension（file.getName（））；
字符串f2=FilenameUtils.getExtension（file2.getName（））；
if（f1.equals（“html”）和&f2.equals（“xml”））{
字符串filename1，filename2；
int end=file.getName（）.lastIndexOf（FilenameUtils.getExtension（file.getName（））；
filename1=file.getName（）.substring（0，end）；
end=file2.getName（）.lastIndexOf（FilenameUtils.getExtension（file2.getName（））；
filename2=file2.getName（）.substring（0，end）；
System.out.println（filename1+“--------------”+filename2）；
if（filename1.equals（filename2））{
System.out.println（“file1”+file.getName（）+“File2”+File2.getName（））；
//第一档
xmlInput=xmlInput.replaceAll（“\\n+|\\r+|\\t+”，”）.replaceAll（“，”）
.replaceAll（&#[a-zA-Z0-9]+；”）.replaceAll（&[a-zA-Z0-9]+；”，“”）
.replaceAll（“\\s+”，”）；
字符串xmlInput2=FileUtils.readFileToString（file2）；
xmlInput2=xmlInput2.replaceAll（“\\n+\\r+\\t+”，”）.replaceAll（“，”）
.replaceAll（&#[a-zA-Z0-9]+；”）.replaceAll（&[a-zA-Z0-9]+；”，“”）
.replaceAll（“\\s+”，”）；
diff_match_patch diff=新的diff_match_patch（）；
LinkedList Differences=diff.diff_main（xmlInput，xmlInput2）；
字符串str=diff.diff_prettyHtml（差异）；
FileUtils.writeStringToFile（新文件（compaired_File+File.separator+File.getName（）），str）；
//字符串text1=“”；
字符串text2=“”；
字符串text3=“”；
用于（差异d：差异）{
if（d.operation==operation.DELETE）{
text1=text1+“”+d.text；
System.err.println（“text1”+text1+“text2”+text2）；
}else if（d.operation==operation.INSERT）{
text2=text2+“”+d.text；
//System.err.println（“text1”+text1+“text2”+text2）；
}else if（d.operation==operation.EQUAL）{
text3=text3+“”+d.text；
}
}
text1=text1+“--->”+file2.getName（）；
}
}
}
}
FileUtils.writeStringToFile（新文件（compaired_File+“/UnMatched.txt”），text1；
}
}

google diff match修补程序api位于以下位置：

https://code.google.com/p/google-diff-match-patch/downloads/detail?name=diff_match_patch_20121119.zip

我的输入链接是：

https://drive.google.com/open?id=0B9sBq5p886c4VC1IOExLZnllcm8