Latex 将bib2gls与rmarkdown一起使用无法呈现术语表

我想在我的rmarkdown文档中使用

bib2gls

latex包，在我编织到pdf文档时插入.bib文件中的首字母缩略词列表

不起作用：

使用.bib文件存储我的首字母缩写词。例如：

缩写.bib文件：

@abbreviation{ecoli, 
short={E.~coli},
long={Escherichia coli}
}


@abbreviation{raustralis ,
short ={R.~ australis},
long={Rickettsia australis}
}

序言.tex

%修复了导致mathspec的词汇表问题
%返回要求首先加载amsmath的错误
\马克特莱特
\让我们重新包装\original@RequirePackage
\让\usepackage\require重新打包
\Maketother
%使用bib2gls
\usepackage[record，缩写，style=index]{glossaries extra}
\setStyle{long short}
\GlsXtrLoadResources[src={缩写}，selection={all}]

rmarkdown文件：

---
输出：
pdf\U文件：
乳胶引擎：Xeletex
包括：
in_头：preamble.tex
标题：“mwe”
---
##降价
这是第一个实例\gls{ecoli}、\gls{raustralis}。这是第二个实例：\gls{ecoli}、\gls{raustralis}。
\printunsrtglossary[标题={缩写}，类型=缩写]

编织rmarkdown文档时的输出如下所示：

工作原理：

删除

\GlsXtrLoadResources[src={缩写}，selection={all}]

并将我的条目添加到序言中

%使用bib2gls
\usepackage[缩写，style=index]{glossaries extra}
\setStyle{long short}
\新缩写{ecoli}{E.~coli}{Escherichia coli}
\新缩写{raustralis}{R.~australis}{Ricketsia australis}

如果可能的话，我想在第一种方法中使用单独的.bib文件。除非有更好的方法在R中执行此操作。会话信息如下：

R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                           LC_TIME=English_United States.1252  

---

问题是

bib2gls

需要运行一个额外的程序，该程序从

bib

文件中提取词汇表条目，但

rmarkdown

不知道这一点。一般来说，如果您想在LaTeX方面做一些更复杂的事情，很有可能

latexmk

已经知道如何做了。我不确定这是不是真的，c.f。但是，您可以使用

```{r echo=FALSE}
Sys.setenv(RSTUDIO_PDFLATEX = "latexmk")
```