Numpy 如何为我的AWS Elastic Beanstalk应用程序安装matplotlib？

我在AWS Elastic Beanstalk上部署matplotlib的时间很长。我的问题来自于一些依赖关系和EB部署随PIP安装的软件包的方式，并且已经尝试按照解决问题的方法

我首先尝试了增量部署，正如链接答案中所建议的那样，通过将matplotlib包堆栈的各个部分分阶段添加到我的

requirements.txt

文件中。但这会花费很长时间（对于每个阶段），并且容易出现故障和超时（这似乎会留下构建目录，从而使后续的包安装暂停）

因此，答案末尾提到的简单解决方案吸引了我：只要

eb-ssh

，用

source /opt/python/run/venv/bin/activate

和

pip手动安装

软件包。但我也不能让它工作。首先，我经常遇到左beind构建目录（如上所述）

但即使去掉这些，我还是会一直

Exception:
Traceback (most recent call last):
  File "/opt/python/run/venv/lib/python2.7/site-packages/pip/basecommand.py", line 122, in main
    status = self.run(options, args)
  File "/opt/python/run/venv/lib/python2.7/site-packages/pip/commands/install.py", line 278, in run
    requirement_set.prepare_files(finder, force_root_egg_info=self.bundle, bundle=self.bundle)
  File "/opt/python/run/venv/lib/python2.7/site-packages/pip/req.py", line 1197, in prepare_files
    do_download,
  File "/opt/python/run/venv/lib/python2.7/site-packages/pip/req.py", line 1375, in unpack_url
    self.session,
  File "/opt/python/run/venv/lib/python2.7/site-packages/pip/download.py", line 582, in unpack_http_url
    unpack_file(temp_location, location, content_type, link)
  File "/opt/python/run/venv/lib/python2.7/site-packages/pip/util.py", line 625, in unpack_file
    untar_file(filename, location)
  File "/opt/python/run/venv/lib/python2.7/site-packages/pip/util.py", line 533, in untar_file
    os.makedirs(location)
  File "/opt/python/run/venv/lib64/python2.7/os.py", line 157, in makedirs
    mkdir(name, mode)
OSError: [Errno 13] Permission denied: '/opt/python/run/venv/build/xxxx'

响应

pip安装xxxx

（和

sudo-pip

失败，未找到

sudo:pip:command

）

我能做些什么来让AWS-EB工作？特别是，我需要做什么才能让简单的SSH+PIP方法工作；还是有其他更好更简单的方法我应该试试

---

FWIW，我有一个

.ebextensions/software.config

和

packages:
  yum:
    gcc-c++: []
    gcc-gfortran: []
    python-devel: []
    atlas-sse3-devel: []
    lapack-devel: []
    libpng-devel: []
    freetype-devel: []
    zlib-devel: []

以及一个以结尾的

requirements.txt

pytz==2014.10
pyparsing==2.0.3
python-dateutil==2.4.0
nose==1.3.4
six>=1.8.0
mock==1.0.1

numpy==1.9.1

matplotlib==1.4.2

大约4个小时后，我到达了numpy（正如EB VirtualNV中的

pip列表所报告的那样）

并且（如果有关系的话）正在使用策略的用户是策略组的一部分

{
  "Version": "2012-10-17",
  "Statement": [
    {
      "Effect": "Allow",
      "Action": [
        "elasticbeanstalk:*",
        "ec2:*",
        "elasticloadbalancing:*",
        "autoscaling:*",
        "cloudwatch:*",
        "s3:*",
        "sns:*",
        "cloudformation:*",
        "rds:*",
        "sqs:*",
        "iam:PassRole"
      ],
      "Resource": "*"
    }
  ]
}

我使用了许多方法在Windows和Linux系统上构建和部署numpy/scipy/matplotlib。我使用过系统提供的软件包管理器（aptitude，rpm）、第三方软件包管理器（pypm）、Python软件包管理器（easy_install，pip）、源代码版本，使用过不同的构建环境/工具（GCC，还有Intel MKL、OpenMP）。在这样做的过程中，我遇到了很多非常恼人的情况，但也学到了很多每种方法的优缺点

我没有弹性豆茎（EB）的经验，但我有EC2的经验。我看到您可以使用SSH连接到一个实例中，然后四处查看。因此，我在下面进一步提出的建议是基于


上述经验和建议
关于Beanstalk等的或多或少明显的边界条件
您的应用程序场景，在这里的另一个问题中描述，等等
事实上，你只是想让事情快速运转

我的建议：首先不要自己建造这些东西。不要使用pip。如果可能，尝试使用Linux发行版的包管理器，让它通过一个命令（例如，
sudo-apt-get-install-python-matplotlib
）处理您所需的所有安装工作

缺点：


可能是旧的软件包版本，具体取决于使用的Linux发行版
非优化构建（例如，未针对英特尔MKL构建，或未利用OpenMP功能或未使用特殊指令集）

优点：


它可以快速下载，因为包很可能缓存在您的计算机附近
它可以快速安装（这些包是预构建的，不涉及编译）
它只是起作用

因此，我希望您可以在这些机器上使用aptitude或rpm或其他任何东西，并在幕后继承分发包维护人员为您所做的伟大工作

一旦您对应用程序充满信心并发现了一些瓶颈或问题，您就有理由使用更新版本的numpy/matplotlib/。。。或者，通过创建优化的构建，您可能有理由拥有更快的版本

编辑：概述方法的EB相关详细信息
同时，我们了解到，默认情况下，EB是基于Red Hat Enterprise Linux运行的。同样，它使用
yum
作为包管理器，包采用RPM格式

Amazon提供了关于可用软件包的文档。在Amazon Linux 2014.09中，提供了以下软件包：

在这个列表中，我们可以找到


numpy-1.7.2
python-matplotlib-0.99.1.2

根据2009年9月发布的“2009-09-21标记为0.99.1版”，matplotlib的这个版本非常古老

我没料到它会这么旧，但它可能足够满足你的需要了。因此，我们继续我们的计划（但如果这是一个拦路虎，我会理解）

现在，我们知道系统Python和EB Python是相互隔离的。这并不意味着EB-Python无法访问系统Python站点包。我们只需要它告诉我们。一种简单而干净的方法是使用EB-Python应该可以访问的包设置适当的目录结构，并通过
sys.path
将该目录与EB-Python通信

显然，我们需要定制EB容器的引导阶段。此处记录了可用的工具：

显然，我们希望使用
软件包
方法，并告诉EB通过yum安装
numpy
和
python matplotlib
软件包。因此，相应的配置文件部分应包含：

 packages:  
  yum:  
   numpy: []  
   python-matplotlib: []  

可能没有必要明确提到
numpy
，这可能是python matplotlib的一个依赖项

此外，我们还需要使用
命令
部分：

您可以使用commands键在EC2实例上执行命令。
命令按名称的字母顺序进行处理，并运行
在设置应用程序和web服务器之前
提取版本文件

以下三个命令创建上述目录，并设置指向numpy/mpl instal的符号链接
 packages:  
  yum:  
   numpy: []  
   python-matplotlib: []  

commands:
  00-create-dir:
    command: "mkdir -p /opt/py26-selected-site-packages"
  01-link-numpy:
    command: "ln -s /usr/lib64/python2.6/site-packages/numpy /opt/py26-selected-site-packages/numpy"
  02-link-mpl:
    command: "ln -s /usr/lib64/python2.6/site-packages/matplotlib /opt/py26-selected-site-packages/matplotlib"

sys.path.append("/opt/py26-selected-site-packages")
from matplotlib import pyplot

sys.path.insert(0, "/opt/py26-selected-site-packages")

[ec2-user@ip-1-1-1-174 ~]$ yum list | grep matplot
python-matplotlib.x86_64            0.99.1.2-1.6.amzn1              amzn-main

packages:
  yum:
    python-matplotlib: [] 
    python-devel: []
    atlas-sse3-devel: []
    lapack-devel: []
    libpng-devel: []
    freetype-devel: []
    zlib-devel: []

sudo docker pull chuseuiti/pynuscimat2.7

sudo docker pull chuseuiti/pynusci

sudo docker login

 sudo docker run -i -t chuseuiti/pynuscimat2.7 bash