Parameters SnakeMake中的链式参数

这似乎适用于蛇形链参数。这样做可以吗，还是会在并行环境中引起问题，应该改用PersistentDict吗

rule a:
    params:
            a = "Param A", b="Param B"
    ...


rule b:
    params: rules.a.params.b

---

我反对这种做法，因为它会导致

例如，现在“规则b”必须始终伴随“规则a”

我这样说是不必要的，因为另一个选项是在中声明外部变量，并让两个param指令都接受它作为参数

config.yaml~

蛇形锉刀~

这在我的管道中是至关重要的，因为我需要对管道的大部分使用相同的通配符约束正则表达式，但我不想最终将所有规则耦合在一起

---

同样适用于对齐器上的质量阈值。有时，为了进行比较，您会在不同的对齐器中使用类似的阈值。

我建议不要使用这种方法，因为它会导致

例如，现在“规则b”必须始终伴随“规则a”

我这样说是不必要的，因为另一个选项是在中声明外部变量，并让两个param指令都接受它作为参数

config.yaml~

蛇形锉刀~

这在我的管道中是至关重要的，因为我需要对管道的大部分使用相同的通配符约束正则表达式，但我不想最终将所有规则耦合在一起

同样适用于对齐器上的质量阈值。有时，为了进行比较，您会在不同的对齐器中使用类似的阈值

a: Param A
b: Param B

configfile: "config.yaml"

rule a:
    ...
    params:
        importantRuleAVar = config["a"]
    ....


rule b:
    ...
    params:
        importantRuleBVar = config["a"]
    ...