在PHP中提取DNA序列的处理信息

各位专家助手大家好

这是我贴出的第一个问题，我看到其他问题都有令人难以置信的答案。我的问题如下

我想通过一个网站（例如FASTSNP网站）提取在处理与DNA序列（SNP：单核苷酸多态性，每个SNP有一个特定的唯一ID）相关的查询后给出的结果（输出），该网站根据给定SNP的排名提供处理，并能够将提取的结果存储在MySQL数据库中。有没有一种方法可以使用regex或任何其他PHP和/或Perl（out）命令来做到这一点？任何人都可以这样做，请帮助我

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提前谢谢！

欢迎来到stackoverflow！首先，我想支持@amon。如果您有任何代码想法，请发布它们。否则，您应该提出一个更精确的问题。也就是说，我将尝试给出一个答案，如果您提供任何进一步的规范，我可以更新它

如果您使用的是序列，或者更一般地说，是生物信息学，您一定要看一看。它提供了生物信息学中最常用数据格式的接口，甚至还提供了某些在线资源（包括数据库）的接口。

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一般来说，还有Perl模块与数据库接口，对于SQL数据库，我想这可能是一个很好的起点，但到目前为止，我自己还没有使用过这些模块。

我谦恭地建议您使用Perl

可以为您运行查询并获得结果。它有一个submit_form方法。链接页面上的简单示例（摘要）向您展示了如何进行查询

一旦你有了结果，你可以用任何你需要的方式来排序结果

还有很多很棒的数据库访问模块

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你能发布一个可能发送到FASTSNP站点的示例查询吗？

查看一些示例输入以及你想从这些输入中提取的数据会非常有帮助。你在编写正则表达式或与数据库接口方面有问题吗？你已经有一些代码了吗？（它是否有效并不重要，但可以帮助我们理解问题）。