Python 2.7 在IPython/Python2.7的新安装中安装Biopython

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我已经安装了Python2.7,并且在安装scipy时遇到了一些问题。通过一些谷歌搜索,我从这里的一个线程()中发现,最好使用MacPorts和IPython安装scipy

伊皮顿看起来很酷,我想试试。到目前为止,一切都太好了——我感到非常高兴,因为我能独自完成这一切

现在,我已经将Biopython与我的Python2.7一起安装(Python2.7的这个版本安装在
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/Python2.7
文件夹中)

由于我过于热衷于尝试Ipython,我(认为)将Python2.7以及Ipython、scipy等重新安装到了一个新目录
/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/Python2.7

然而,现在我在Python2.7的新安装中没有Biopython。那么,我必须在新安装的Python2.7中重新安装Biopython吗

如果是,如何将安装定向到此文件夹

它会像下面这样(假设我在下载文件夹中有
biopython-1.61.tar.gz
):

我想知道我在这里是不是有根据。我不想把我现在的一切搞砸


我有Mac OS X V10.6.8。

对于Python新手来说,最困难的事情之一是确定所有软件包的安装。Python社区正在积极讨论这项正在进行的工作

我建议你选择一个商业发行版,它能为你提供一切你想要的东西。通过这种方式,您可以开始学习使用Python,而不必弄清楚如何让一切正常工作

我建议:


以下内容对我有用(从):

  • 将我使用MacPorts执行的Python2.7/iPython2.7安装设置为默认设置

    $ sudo port select --set python python27
    $ sudo port select --set ipython ipython27
    
  • 检查是否可通过MacPorts获得Biopython

    $ port search biopython
    
  • 安装Biopython

    $ sudo port install py27-biopython  # install Biopython
    

  • 谢谢你,马特。幸运的是我能解决这个问题。但是现在我已经完成了Python的多个安装,我想知道是否要卸载以前的安装。
    $ sudo port install py27-biopython  # install Biopython