Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/8/python-3.x/19.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
Python 如何访问snakemake.input[0]?_Python_Python 3.x_Snakemake - Fatal编程技术网

Python 如何访问snakemake.input[0]?

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这应该是一个简单的问题,但就我的一生而言,我无法解决它。我有一个非常非常简单的蛇形文件(如下所示):

在我的
test.py
文件中,我正在执行以下操作:

import snakemake
print(snakemake.input[0])
但我无法访问
snakemake.input[0]
。他们有一个和我一样简单的例子,但我无法让它发挥作用。此外,在Python交互式shell中,我能够
导入snakemake
,但我得到一个错误:

ImportError: No module named snakemake
从我的
test.py
脚本导入时

我正在从与
Snakefile
相同文件夹中的命令行调用
snakemake test
,以运行此操作


非常感谢您的帮助。

我通过在
/usr/bin/snakemake
上删除snakemake安装,然后按照安装指南重新安装,解决了我的问题。

您能尝试不导入snakemake吗?@Maarten vd Sande,我刚刚编辑了我的帖子。我可以通过卸载和重新安装来修复我的问题。请不要将解决方案/答案作为编辑发布。如果你解决了自己的问题,你可以将其作为答案发布(甚至接受)
ImportError: No module named snakemake