Python 运行此代码时我做错了什么？

首先，我绝不是一个编程专家，也不精通python，所以如果这是一个愚蠢的问题，请原谅我。我正在尝试运行下面的代码，以便使用“ID”文件将fasta文件筛选为我想要的序列，但每次运行它时，都会出现一个错误。非常感谢您的帮助

"""
%prog file.fasta wanted_ids.txt
"""
from Bio import SeqIO
import sys

wanted = [line.strip() for line in open(sys.argv[2])]
seqiter = SeqIO.parse(open(sys.argv[1]), 'fasta')
SeqIO.write((seq for seq in seqiter if seq.id in wanted), sys.stdout, "fasta")

这是我得到的错误：

File "filter.py", line 7, in <module>
    wanted = [line.strip() for line in open(sys.argv[2])]
IndexError: list index out of range

文件“filter.py”，第7行，在
需要=[line.strip（）用于打开的行（sys.argv[2]）]
索引器：列表索引超出范围

我希望它能帮助你

打开（sys.argv[2]）作为文件：
对于文件中的行：

只有在运行程序时未向程序传递预期数量的参数时，才会发生您描述的异常。

sys.argv

变量包含程序的参数。它将是一个列表，

sys.argv[0]

将具有脚本本身的文件名，而后面的值将是传入的后面的参数

程序的docstring（

%prog file.fasta-id.txt

）建议您向程序传递两个参数，其中一个是

.fasta

文件，另一个是

.txt

文件。您忽略了其中一个或两个参数，因此程序无法查找

sys.argv[2]

，并引发一个

索引器

您可能希望向程序中添加代码，以检查参数的数量，并在获得错误数量时提供更有用的异常：

from Bio import SeqIO
import sys

if len(sys.argv) != 3:
    sys.exit("Bad arguments! Usage: {} <file.fasta> <wanted_ids.txt>".format(sys.argv[0]))

wanted = [line.strip() for line in open(sys.argv[2])]
#...

来自Bio导入序列
导入系统
如果len（sys.argv）！=三：
sys.exit（“错误参数！用法：{}”。格式（sys.argv[0]））
需要=[line.strip（）用于打开的行（sys.argv[2]）]
#...

当您不理解时，请尽量避免列表理解，并使用打印出的值进行调试。请阅读。问题标题应该是问题的摘要，不鼓励使用“为什么此代码不起作用”之类的标题。最好添加一些解释，以便用户更容易地使用您的答案。只有代码的答案有时无法满足用户的需求，而且很难理解-查看