Cython:can'；t将Python对象转换为'；双*'；

我正在写一个Cython包装到一个C函数。我有一个带有以下签名的pxd文件：

double contr_hrr(int lena, double xa, double ya, double za, double *anorms)

当我试图从pyx文件调用它时

...
return contr_hrr(len(acoefs),a.origin[0],a.origin[1],a.origin[2],anorms2)

其中anroms2是一个python列表，我得到错误消息：

cython/ctwo.pyx:35:80: Cannot convert Python object to 'double *'

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如何将python列表作为双数组传递给C函数？

我认为您不能这样做，只能自己转换它：

cimport cython
from libc.stdlib cimport malloc, free

...
cdef double *anorms
cdef unsigned int i;

anorms = <double *>malloc(len(anorms2)*cython.sizeof(double))
if anorms is NULL:
    raise MemoryError()

for i in xrange(len(anorms2)):
    anorms[i] = anorms2[i]

return contr_hrr(len(acoefs),a.origin[0],a.origin[1],a.origin[2],anorms)

如果你可以切换到C++，你可以直接从<代码>列表[FLASH ] <代码>到<代码>矢量< /代码>：

并直接从Python端调用：

anorms2 = [12.0, 0.5, ...]
py_contr_hrr(anorms2, ....)

资料来源：

但是我不知道这是不是一个你可以考虑的选择…当然，这取决于项目的约束条件

编辑：我不知道Nikita的方法（顺便说一句，这是一种优雅的方法），我也不知道哪种方法最适合在大型阵列上的性能

cimport

阵列

：

from cpython cimport array

从列表中创建数组对象。数组类构造函数将完成分配内存和遍历列表（实际上可以是任何iterable）的所有繁重工作

将其数据传递给您的函数：

return contr_hrr(.., anorms2_arr.data.as_doubles)

数组

是一个数组。Cython在顶部添加了一些特殊的支持，比如缓冲接口和通过

arr.data.as\u xxx

直接访问底层内存块。不幸的是，这种支持只是有文档记录的。

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您还可以在中找到有关数组使用的一些详细信息。

我最后做的是确保anorms数组在代码的python部分作为数组进行维护，然后按照Nikita的方法使用.data.as_doubles属性将它们动态转换为double。如果我这样做，与在C中以本机方式完成所有工作相比，它的开销似乎非常小

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由于种种平凡的原因，我还没有尝试过numpy方法。

数组的东西最近有多新？当我尝试cimport array时，我得到了“cython/ctwo.pyx:3:0:'array.pxd'not found”。@Rick我刚刚检查了0.19.1（最后一个）稳定版本，文件就在那里。还使用我的当前版本

0.18

测试了导入：它对我来说运行良好。。。嗯，你的是什么？是加进去的。最新版本通常是最好的。啊！我使用cython 0.16的原因不明。我想我最好升级一下。刚刚尝试通过Macports安装cython，但版本仍然显示为0.16。如果您有机会测试不同的方法，我很想知道哪种方法最快…@Golgauth-我一定会尝试一下。代码的速度是旧方法的2倍，在旧方法中，我使用C直接包装C例程。您的最终方法是什么？也许你可以在上面发表你自己的答案…@Golgauth-Done，见下文。非常感谢你的帖子。我现在正在尝试尼基塔的方法，如果不行，我就试试这个。

from cpython cimport array

cdef array.array anorms2_arr = array.array('d', anorms2)

return contr_hrr(.., anorms2_arr.data.as_doubles)