Python 将数据帧转换为字典

Python 将数据帧转换为字典,python,pandas,dictionary,dataframe,Python,Pandas,Dictionary,Dataframe,我有一个四列的数据框。我想将此数据帧转换为python字典。我希望第一列的元素是键,同一行中其他列的元素是值 数据帧: ID A B C 0 p 1 3 2 1 q 4 3 2 2 r 4 0 9 输出应如下所示: 字典: {'p': [1,3,2], 'q': [4,3,2], 'r': [4,0,9]} 尝试使用Zip df = pd.read_csv("file") d= dict([(i,[a,b,c ])

我有一个四列的数据框。我想将此数据帧转换为python字典。我希望第一列的元素是
,同一行中其他列的元素是

数据帧:

    ID   A   B   C
0   p    1   3   2
1   q    4   3   2
2   r    4   0   9  
输出应如下所示:

字典:

{'p': [1,3,2], 'q': [4,3,2], 'r': [4,0,9]}

尝试使用
Zip

df = pd.read_csv("file")
d= dict([(i,[a,b,c ]) for i, a,b,c in zip(df.ID, df.A,df.B,df.C)])
print d
输出:

{'p': [1, 3, 2], 'q': [4, 3, 2], 'r': [4, 0, 9]}
该方法将列名设置为字典键,因此您需要稍微改变数据帧的形状。将“ID”列设置为索引,然后转置数据帧是实现这一点的一种方法

to_dict()
还接受一个“orient”参数,您需要该参数为每列输出一个值列表。否则,将为每列返回一个形式为
{index:value}
的字典

可以使用以下行完成这些步骤:

>>> df.set_index('ID').T.to_dict('list')
{'p': [1, 3, 2], 'q': [4, 3, 2], 'r': [4, 0, 9]}

如果需要不同的字典格式,下面是可能的orient参数的示例。考虑下面的简单数据框:

>>> df = pd.DataFrame({'a': ['red', 'yellow', 'blue'], 'b': [0.5, 0.25, 0.125]})
>>> df
        a      b
0     red  0.500
1  yellow  0.250
2    blue  0.125
然后,选项如下所示

dict-默认设置:列名是键,值是索引:数据对的字典

>>> df.to_dict('dict')
{'a': {0: 'red', 1: 'yellow', 2: 'blue'}, 
 'b': {0: 0.5, 1: 0.25, 2: 0.125}}
列表-键是列名,值是列数据列表

>>> df.to_dict('list')
{'a': ['red', 'yellow', 'blue'], 
 'b': [0.5, 0.25, 0.125]}
系列类似于“列表”,但值是系列

>>> df.to_dict('series')
{'a': 0       red
      1    yellow
      2      blue
      Name: a, dtype: object, 

 'b': 0    0.500
      1    0.250
      2    0.125
      Name: b, dtype: float64}
拆分-将列/数据/索引拆分为键,值分别为列名、行和索引标签的数据值

>>> df.to_dict('split')
{'columns': ['a', 'b'],
 'data': [['red', 0.5], ['yellow', 0.25], ['blue', 0.125]],
 'index': [0, 1, 2]}
记录-每行成为一个字典,其中键是列名,值是单元格中的数据

>>> df.to_dict('records')
[{'a': 'red', 'b': 0.5}, 
 {'a': 'yellow', 'b': 0.25}, 
 {'a': 'blue', 'b': 0.125}]
索引与“记录”类似,但它是一个字典字典,以键作为索引标签(而不是列表)

遵循以下步骤: 假设您的数据帧如下所示:

>>> df
   A  B  C ID
0  1  3  2  p
1  4  3  2  q
2  4  0  9  r
    >>> dictionary
    {'q': {'A': 4, 'B': 3, 'D': 2}, 'p': {'A': 1, 'B': 3, 'D': 2}, 'r': {'A': 4, 'B': 0, 'D': 9}}
1.使用
set_index
ID
列设置为数据帧索引。 2.使用
orient=index
参数将索引作为字典键。 结果如下:

>>> df
   A  B  C ID
0  1  3  2  p
1  4  3  2  q
2  4  0  9  r
    >>> dictionary
    {'q': {'A': 4, 'B': 3, 'D': 2}, 'p': {'A': 1, 'B': 3, 'D': 2}, 'r': {'A': 4, 'B': 0, 'D': 9}}
3.如果需要将每个示例作为列表,请运行以下代码。确定列顺序
如果您不介意字典值是元组,可以使用itertuples:

>>> {x[0]: x[1:] for x in df.itertuples(index=False)}
{'p': (1, 3, 2), 'q': (4, 3, 2), 'r': (4, 0, 9)}
DataFrame.to_dict()
将数据帧转换为字典

示例

>>> df = pd.DataFrame(
    {'col1': [1, 2], 'col2': [0.5, 0.75]}, index=['a', 'b'])
>>> df
   col1  col2
a     1   0.1
b     2   0.2
>>> df.to_dict()
{'col1': {'a': 1, 'b': 2}, 'col2': {'a': 0.5, 'b': 0.75}}
有关详细信息,请参见此

关于我的使用(节点名称和xy位置),我找到了@user4179775对最有用/直观的答案:

import pandas as pd

df = pd.read_csv('glycolysis_nodes_xy.tsv', sep='\t')

df.head()
    nodes    x    y
0  c00033  146  958
1  c00031  601  195
...

xy_dict_list=dict([(i,[a,b]) for i, a,b in zip(df.nodes, df.x,df.y)])

xy_dict_list
{'c00022': [483, 868],
 'c00024': [146, 868],
 ... }

xy_dict_tuples=dict([(i,(a,b)) for i, a,b in zip(df.nodes, df.x,df.y)])

xy_dict_tuples
{'c00022': (483, 868),
 'c00024': (146, 868),
 ... }

附录

后来我又回到这个问题上,做了其他相关的工作。这是一种更接近于公认答案的方法

node_df = pd.read_csv('node_prop-glycolysis_tca-from_pg.tsv', sep='\t')

node_df.head()
   node  kegg_id kegg_cid            name  wt  vis
0  22    22       c00022   pyruvate        1   1
1  24    24       c00024   acetyl-CoA      1   1
...
将数据帧转换为[列表],{dict},{dict of{dict},…

根据已接受的答复:

node_df.set_index('kegg_cid').T.to_dict('list')

{'c00022': [22, 22, 'pyruvate', 1, 1],
 'c00024': [24, 24, 'acetyl-CoA', 1, 1],
 ... }

node_df.set_index('kegg_cid').T.to_dict('dict')

{'c00022': {'kegg_id': 22, 'name': 'pyruvate', 'node': 22, 'vis': 1, 'wt': 1},
 'c00024': {'kegg_id': 24, 'name': 'acetyl-CoA', 'node': 24, 'vis': 1, 'wt': 1},
 ... }
在我的例子中,我想做同样的事情,但是要使用Pandas dataframe中的选定列,所以我需要对这些列进行切片。有两种方法

  • 直接:
  • (见:)

  • “间接地:”首先,从Pandas数据帧中分割所需的列/数据(同样,两种方法)
  • 然后可以使用它创建一个字典字典

    node_df_sliced.set_index('kegg_cid').T.to_dict('dict')
    
    {'c00022': {'name': 'pyruvate', 'vis': 1, 'wt': 1},
     'c00024': {'name': 'acetyl-CoA', 'vis': 1, 'wt': 1},
     ... }
    

    字典应该是这样的:

    {'red': '0.500', 'yellow': '0.250, 'blue': '0.125'}
    
    需要从数据帧中删除,如:

            a      b
    0     red  0.500
    1  yellow  0.250
    2    blue  0.125
    
    最简单的方法是:

    dict(df.values)
    
    下面的工作片段:

    import pandas as pd
    df = pd.DataFrame({'a': ['red', 'yellow', 'blue'], 'b': [0.5, 0.25, 0.125]})
    dict(df.values)
    
    有输出

    {'p': [1, 3, 2], 'q': [4, 3, 2], 'r': [4, 0, 9]}
    

    Dataframe.to_dict()
    Dataframe.to_dict()
    将使
    A、B、C
    键代替
    p、q、r
    @jezrael如何获得以下输出?{2:{'p':[1,3]},2:{'q':[4,3]},9:{'r':[4,0]}对于同一个数据集?@jezrael列与上述问题{'c':{'ID':'A','B'}等价。这个问题只涉及一列。这将是一行:
    df.set_index('ID').T.to_dict('list')
    ,用于数据帧中的一条记录。df.T.to_dict()[0]
    df.to_dict('records')
    是大多数现代软件希望dict与
    json
    类似的模式相匹配的方式。最后一位似乎使用dict理解代替for循环+列表理解(3行->1)会更简单。不管是哪种方式,尽管有选项很好,但最上面的答案要短得多。这很方便,因为它清楚地解释了如何使用特定的列或标题作为索引。是的,但OP明确表示他们希望行索引是键,而不是列标签。整洁 ! 不过,它只适用于两列数据帧。
    {'red': '0.500', 'yellow': '0.250, 'blue': '0.125'}
    
            a      b
    0     red  0.500
    1  yellow  0.250
    2    blue  0.125
    
    dict(df.values)
    
    import pandas as pd
    df = pd.DataFrame({'a': ['red', 'yellow', 'blue'], 'b': [0.5, 0.25, 0.125]})
    dict(df.values)
    
    df = pd.DataFrame([['p',1,3,2], ['q',4,3,2], ['r',4,0,9]], columns=['ID','A','B','C'])
    my_dict = {k:list(v) for k,v in zip(df['ID'], df.drop(columns='ID').values)}
    print(my_dict)
    
    {'p': [1, 3, 2], 'q': [4, 3, 2], 'r': [4, 0, 9]}