Python 使用更改的元组写入文件

我的代码在一个DNA序列中运行，并记录它在该序列中遇到的ORF的位置。我正在努力完成两件事

使程序循环，直到它找到所有ORF，而不是它运行的第一个ORF

将结果写入文本文件

我将其设置为将结果写入文本文件，但结果存储在元组中（每次在序列中找到ORF时，元组都会发生变化）。这使得最后的文本文件只包含输入的最后一个序列的最后一个ORF，而不是创建列表

我的代码：

class SeqAnalyzer :
    def __init__(self,sequence):
        self.input = Seq(sequence)
        self.reverse = self.input.reverse_complement()
        self.sequence = str(self.input)
        self.stopcodons = ["TAG", "TAA", "TGA"]
        self.start = 'ATG'
        self.length = 0
        self.result = ("+",0,0,0,0)

    def codon(self,frame):
        start = frame
        while start +3 <=len(self.sequence):
                yield (self.sequence[start:start+3],start)
                start += 3


    def ORF(self, frame, direction):
        orf_beg = 0
        for i, index in self.codon(frame):
            if (
                (str(i) in self.start) or
                (not self.start and i not in str(self.stopcodons))
                ):
                    orf_beg = index + 1
            elif i in self.stopcodons:
                orf_ending = index + 3
                length = (orf_ending - orf_beg) + 1
                if length > self.length:
                    self.length = length
                    self.result = (direction, frame, orf_beg, orf_ending, length)
                break

    def direction(self):
        direction = "+"
        for frame in range(3):
          self.ORF(frame, direction)
        direction = "-"
        for frame in range(3):
            self.sequence = self.reverse
            self.ORF(frame, direction)
        self.results()

    def results(self):
        print(self.result)
        file = open("tass2ORFdata-ATG-100.txt","w")
        file.write("{}{:d} {:>5d}..{:>5d} {:>5d}".format(
                self.result[0], self.result[1], self.result[2],
                self.result[3], self.result[4])
                )

而不是元组在不同点包含的所有变体：

('+', 0, 4, 9, 6)
('+', 1, 5, 10, 6)
('+', 0, 0, 6, 7)
('-', 0, 4, 9, 6)
('-', 1, 5, 10, 6)
('+', 2, 0, 11, 12)
('+', 0, 4, 9, 6)
('+', 1, 5, 10, 6)
('+', 0, 0, 6, 7)
('-', 0, 4, 9, 6)
('-', 1, 5, 10, 6)
('+', 1, 0, 13, 14)

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我已经尝试了各种方法来解决这个问题，但到目前为止还没有一种方法有效。

在您的

\uuuu init\uuu

集中

    self.result = [("+",0,0,0,0), ]

然后，您需要将

附加到它，而不是分配给
self.result
：

self.result.append(direction, frame, ... )

然后在打印时：

for row in self.result:
    file.write("...".format(row))

在您的
\uuuu init\uuuu
集中

    self.result = [("+",0,0,0,0), ]

然后，您需要将
附加到它，而不是分配给
self.result
：

self.result.append(direction, frame, ... )

然后在打印时：

for row in self.result:
    file.write("...".format(row))