使用cython扩展打包python

我正在尝试构建一个同时使用python和cython模块的包。我遇到的问题是在构建和安装之后的导入，我不确定如何从构建过程生成的

文件导入文件

在构建我的文件夹结构之前，如下所示

root/
├── c_integrate.c
├── c_integrate.pyx
├── cython_builder.py
├── __init__.py
├── integrator_class.py
├── integrator_modules
│   ├── cython_integrator.py
│   ├── __init__.py
│   ├── integrator.py
│   ├── numba_integrator.py
│   ├── numpy_integrator.py
│   ├── quadratic_error.png
│   ├── report3.txt
│   ├── report4.txt
│   └── report5.txt
├── report6.txt
├── setup.py
└── test
    ├── __init__.py
    └── test_integrator.py

使用
python3.5 setup.py build构建
将在
根目录中提供此新文件夹

root/build/
├── lib.linux-x86_64-3.5
│   ├── c_integrate.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so
│   ├── integrator_modules
│   │   ├── cython_integrator.py
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── integrator.py
│   │   ├── numba_integrator.py
│   │   └── numpy_integrator.py
│   └── test
│       ├── __init__.py
│       └── test_integrator.py

setup.py
文件如下所示

from setuptools import setup, Extension, find_packages
import numpy

setup(
    name = "integrator_package",
    author = "foo",
    packages = find_packages(),
    ext_modules = [Extension("c_integrate", ["c_integrate.c"])],
    include_dirs=[numpy.get_include()],
)

我的问题是：如何将函数的导入语句从
.so
文件写入
根
和
cython\u integrator
目录中的
integrator\u class.py
和
test\u integrator
中。附加到
sys.path
似乎是一个我不太喜欢的快速而肮脏的解决方案

编辑：
正如评论中指出的，我还没有安装这个软件包。这是因为我不知道要从
导入什么。因此
文件
没有特定顺序：

文件setup.py通常位于项目根目录下。例如：

library_name/
    __init__.py
    file1.py
setup.py
README


然后，生成目录出现在项目源旁边，而不是项目源中

要在Python中导入文件c_integrate.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so，只需导入“c_integrate”。命名的其余部分将自动处理，因为它只是平台信息。看

一个有效的模块是

带有
modulename/\uuuuu init\uuuuu.py
文件的目录
名为
modulename.py的文件

名为
modulename.PLATFORMINFO.so的文件

当然位于Python路径中。因此，对于已编译的Cython模块，不需要
\uuuu init\uuuu.py
文件

对于您的情况，请在项目目录中移动Cython代码，然后执行相对导入
import.c\u integrate
或从integrator\u模块导入完整的
，后者仅在安装软件包时起作用

其中一些信息可以在我关于Cython模块的博客文章中找到

我相信，这应该让你建立一个适当的包，评论下面如果没有

编辑：要完成配置（请参见下面的注释），海报也会

修复了setup.py文件中的模块路径，使其成为从PYTHONPATH:
扩展名（“integrator\u package.integrator\u modules.c\u integrat”）开始的完整模块名‌​或者“，[“integrator\u package/integrator\u modules/c\u integrator.c”]
而不是
扩展（“c\u integrate”，[“c\u integrate.c”]）]
对模块进行Cythonize、构建并与同一个Python解释器一起使用
进一步说明：setup.py文件也可以对文件进行cythonize。将
.pyx
文件而不是
.c
文件作为源文件

cythonize(Extension('integrator_package.integrator_modules.c_integrat‌​or',
          ["integrator_package/integrator_modules/c_integrator.pyx"],
          include_dirs=[numpy.get_include()]))

没有具体顺序：

文件setup.py通常位于项目根目录下。例如：

library_name/
    __init__.py
    file1.py
setup.py
README


然后，生成目录出现在项目源旁边，而不是项目源中

要在Python中导入文件c_integrate.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so，只需导入“c_integrate”。其余命名将自动处理，因为它只是平台信息。请参阅

一个有效的模块是

带有
modulename/\uuuuu init\uuuuu.py
文件的目录
名为
modulename.py的文件

名为
modulename.PLATFORMINFO.so的文件

当然位于Python路径中。因此，对于已编译的Cython模块，不需要
\uuuu init\uuuu.py
文件

对于您的情况，请在项目目录中移动Cython代码，然后执行相对导入
import.c\u integrate
或从integrator\u模块导入完整的
，后者仅在安装软件包时起作用

其中一些信息可以在我关于Cython模块的博客文章中找到

我相信，这应该让你建立一个适当的包，评论下面如果没有

编辑：要完成配置（请参见下面的注释），海报也会

修复了setup.py文件中的模块路径，使其成为从PYTHONPATH:
扩展名（“integrator\u package.integrator\u modules.c\u integrat”）开始的完整模块名‌​或者“，[“integrator\u package/integrator\u modules/c\u integrator.c”]
而不是
扩展（“c\u integrate”，[“c\u integrate.c”]）]
对模块进行Cythonize、构建并与同一个Python解释器一起使用
进一步说明：setup.py文件也可以对文件进行cythonize。将
.pyx
文件而不是
.c
文件作为源文件

cythonize(Extension('integrator_package.integrator_modules.c_integrat‌​or',
          ["integrator_package/integrator_modules/c_integrator.pyx"],
          include_dirs=[numpy.get_include()]))

相关吗？似乎你没有像@DavidW指出的那样安装你构建的包。问题
pip install path/to/root/
或
pip install--editable=path/to/root/
将构建的文件与python结合起来。是的，我还没有安装它-但我的问题是，既然
。所以
文件被命名为特定于平台的，我不知道现在如何导入它。特别是由于
lib.linux…
文件夹没有
\uuuu init\uuuu.py
文件。另外：在我安装后，只需尝试重命名
。因此
文件并导入它会引发
系统错误：父模块“”未加载，无法执行相对导入
相关吗？似乎您没有安装你像@DavidW那样构建的包指出。问题
pip install path/to/root/
或
pip install--editable=path/to/root/
为了将构建的文件与python结合起来。是的，我还没有安装它-但我的问题是，由于
文件被命名为特定于平台的文件，我不知道如何导入它。特别是自从e
lib.linux…
文件夹没有
\uuuuu init\uuuuuu.py
文件