序列输出循环-python

我一直在努力想办法让我的序列打印出来，在序列中用6-mer在单独的行上。同样（注意每行的间距）：

到目前为止，我已经能够获得字符串形式的序列，如图所示：

from Bio import SeqIO
record = SeqIO.read(open("testSeq.fasta"), "fasta")
sequence = str(record.seq)

然而，我似乎能想出的打印6-mers的唯一方法是：

print sequence 
print sequence[0:5]
print "", sequence[1:6]
print "", "", sequence[2:7]
print "", "", "", sequence [3:8]
etc

我觉得应该有一个更简单的方法。我试过这个，但似乎不起作用：

x = 0
y = 6
for sequence in sequence[x:y]
    print sequence
    x = x + 1
    y = y + 1

如果您对我如何完成这项任务有任何意见，我将不胜感激。我现在只使用python几天了，如果我的问题看起来很简单，我很抱歉

谢谢

这应该有效：

width = 6
for i in range(len(sequence) - width):
    print " " * i + sequence[i:i+width]

---

您可以尝试以下方法（据我所知，您正在使用python2）

输出：

atgcta
 tgctag
  gctagt
   ctagtc
    tagtca
     agtcat
      gtcatc
       tcatc
        catc
         atc
          tc
           c

---

“

在打印时不占用任何空间，但在打印时，任何逗号分隔都将替换为空格。

seq = "atgctagtcatc"
spaces = " "
for i in range(0, len(seq)):
    print spaces*i+seq[i:i+6]

atgcta
 tgctag
  gctagt
   ctagtc
    tagtca
     agtcat
      gtcatc
       tcatc
        catc
         atc
          tc
           c