Python:将浮点字符串解压为复数

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我对编码相当陌生,我从二进制文件中读取信号。数据定向为两个4字节浮点,组成一个复数,最多可重复1500个条目

我一直在使用for循环来提取数据并将复数附加到数组中

for x in range(dimX):
    for y in range(dimY):
        complexlist=[]
        #2 floats, each 4 bytes, is one complex number
        trace=stream.readBytes(8*dimZ)
        #Unpack as list of floats
        floatlist=struct.unpack("f"*2*dimZ,trace)
        for i in range(0,len(floatlist)-1,2):
            complexlist.append(complex(floatlist[i],floatlist[i+1]))        
        data[x][y]=np.array(complexlist)

dimX可能有数千个,DimY通常是是的,有。您可以跳过python复杂类型的步骤,因为在内部,numpy将
n
复数数组表示为
2n
浮点数组

以下是REPL中的一个简单示例,说明了其工作原理:

>>> import numpy as np
>>> a = np.array([1.,2.,3.,4.])
>>> a
array([ 1.,  2.,  3.,  4.])
>>> a.dtype
dtype('float64')
>>> a.dtype = complex
>>> a
array([ 1.+2.j,  3.+4.j])
>>> 
但是请注意,如果初始数组具有
dtype
而不是
float
,则这不起作用

>>> a = np.array([1,2,3,4])
>>> a
array([1, 2, 3, 4])
>>> a.dtype
dtype('int64')
>>> a.dtype = complex
>>> a
array([  4.94065646e-324 +9.88131292e-324j,
         1.48219694e-323 +1.97626258e-323j])
>>>
就你而言。您想要的数据类型是
np.dtype('complex64')
,因为每个复数都是64位(2*4*8)

这会让你的速度大大加快。下面是REPL中关于
numpy.frombuffer()
如何工作的示例

>>> binary_string = struct.pack('2f', 1,2)
>>> binary_string
'\x00\x00\x80?\x00\x00\x00@'
>>> numpy.frombuffer(binary_string, dtype=np.dtype('complex64'))
array([ 1.+2.j], dtype=complex64)
>>> 
编辑:我不知道存在
numpy.frombuffer()
。因此,我创建了一个字符数组,然后更改了数据类型以获得相同的效果。谢谢@wim

编辑2:

至于进一步的速度优化,使用列表理解而不是显式for循环可能会提高性能

for x in range(dimX):
    data[x] = [np.frombuffer(stream.readBytes(8*dimZ), dtype=np.dtype('complex64')) for y in range(dimY)]
还有一个层次:

data = [[np.frombuffer(stream.readBytes(8*dimZ), dtype=np.dtype('complex64'))
         for y in range(dimY)]
         for x in range(dimX)]

你一定要开始考虑numpy的C速度。可能是'numpy.frombuffer',并使用numpy中的一个复杂数据类型,而不是python的复杂数据类型。最里面的循环可以通过理解和itertools展开。
data = [[np.frombuffer(stream.readBytes(8*dimZ), dtype=np.dtype('complex64'))
         for y in range(dimY)]
         for x in range(dimX)]