Python 如何解决；ECitMatch（）为参数'；获取了多个值；b数据'&引用；？

我是第一次使用

bioservices

Python包。现在我将使用它来检索两个引用的PMID，给定指定的信息，这是我尝试过的代码：

from bioservices import EUtils
s = EUtils()
print(s.ECitMatch("pubmed",retmode="xml", bdata="proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|%0Dscience|1987|235|182|palmenberg+ac|Art2|"))

但它发生了一个错误：

TypeError:ECitMatch（）为参数“bdata”获取了多个值

---

有人能帮我解决这个问题吗？

我想问题是你有一个未命名的参数（

publimed

）；如果查看，可以看到第一个参数应该是

bdata

；但是，如果您像这样提供参数，则不清楚

bdata

是

“pubmed”

还是命名参数

bdata

，因此您会得到错误

您可以使用以下最简单的示例重现它：

def dummy(a, b): 
   return a, b

dummy(10, a=3)

会回来的

TypeError:dummy（）为参数“a”获取了多个值

如果删除

“pubmed”

，错误将消失，但输出仍不完整：

from bioservices import EUtils

s = EUtils()

print(s.ECitMatch("proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|%0Dscience|1987|235|182|palmenberg+ac|Art2|"))

返回

'proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|2014248\n'

因此，只考虑第一份出版物。您可以使用

\r

获得这两种方法的结果：

print(s.ECitMatch(bdata="proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|\rscience|1987|235|182|palmenberg+ac|Art2|"))

会回来的

proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|2014248
science|1987|235|182|palmenberg+ac|Art2|3026048

我认为您既不必指定

retmod

，也不必指定数据库（

pubmed

）；如果您查看我上面链接的源代码，您可以看到：

query = "ecitmatch.cgi?db=pubmed&retmode=xml"

---

因此，它似乎总是使用

pubmed

和

xml

我认为问题在于您有一个未命名的参数（

pubmed

）；如果查看，可以看到第一个参数应该是

bdata

；但是，如果您像这样提供参数，则不清楚

bdata

是

“pubmed”

还是命名参数

bdata

，因此您会得到错误

您可以使用以下最简单的示例重现它：

def dummy(a, b): 
   return a, b

dummy(10, a=3)

会回来的

TypeError:dummy（）为参数“a”获取了多个值

如果删除

“pubmed”

，错误将消失，但输出仍不完整：

from bioservices import EUtils

s = EUtils()

print(s.ECitMatch("proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|%0Dscience|1987|235|182|palmenberg+ac|Art2|"))

返回

'proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|2014248\n'

因此，只考虑第一份出版物。您可以使用

\r

获得这两种方法的结果：

print(s.ECitMatch(bdata="proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|\rscience|1987|235|182|palmenberg+ac|Art2|"))

会回来的

proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|2014248
science|1987|235|182|palmenberg+ac|Art2|3026048

我认为您既不必指定

retmod

，也不必指定数据库（

pubmed

）；如果您查看我上面链接的源代码，您可以看到：

query = "ecitmatch.cgi?db=pubmed&retmode=xml"

---

因此，它似乎总是在这里使用

pubmed

和

xml

两个问题：语法和bug

正确的语法是：

从生物服务导入EUTIL
s=EUtils（）
query=“proc+natl+acad+sci+u+s+a | 1991 | 88 | 3248 | mann+bj | Art1 |%0Dscience | 1987 | 235 | 182 | palmenberg+ac | Art2 |”
打印（s.ECitMatch（查询））

实际上，与ICitMatch相关的底层服务只有一个数据库（pubmed）和一种格式（xml），因此，这两个参数不可用：有硬编码的。因此，只需要一个参数：您的查询

至于第二个问题，如上所述，您的查询将只返回一个发布。URL请求无法正确解释特殊字符%0D（代替回车符），这是一个问题。github上的最新版本或pypi网站（如果您使用的是1.7.5版）现在考虑使用此回车符（或\n\r或%0d）

感谢您填写生物服务页面上的问题并引起我的注意

---

免责声明：我是bioservices的主要作者，这里有两个问题：syntaxic和bug

正确的语法是：

从生物服务导入EUTIL
s=EUtils（）
query=“proc+natl+acad+sci+u+s+a | 1991 | 88 | 3248 | mann+bj | Art1 |%0Dscience | 1987 | 235 | 182 | palmenberg+ac | Art2 |”
打印（s.ECitMatch（查询））

实际上，与ICitMatch相关的底层服务只有一个数据库（pubmed）和一种格式（xml），因此，这两个参数不可用：有硬编码的。因此，只需要一个参数：您的查询

至于第二个问题，如上所述，您的查询将只返回一个发布。URL请求无法正确解释特殊字符%0D（代替回车符），这是一个问题。github上的最新版本或pypi网站（如果您使用的是1.7.5版）现在考虑使用此回车符（或\n\r或%0d）

感谢您填写生物服务页面上的问题并引起我的注意

免责声明：我是《生物服务》的主要作者