Python 按两列对PyTables表进行排序

我想对PyTables表进行排序。在单个列上排序很容易：我可以为我要排序的列创建一个cs_索引，然后使用Table.itersorted（）以排序的顺序获取行，然后逐行插入到新表中）

问题是我想对一个表按两列进行排序

该表的格式如下：

chr   start   end    
------------------
chr1  1000    2000
chr1  1500    3000
chr2  1000    5000
chr2  1200    2000

在本例中，顺序是正确的，即首先按“chr”排序，然后按“start”排序。是否有可能以优雅的方式实现这种两列排序

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另外，我知道我可以通过提取列进行排序，然后使用numpy.lexsort对内存中的numpy数组进行排序，但是我正在处理的数据有时可能太大（可能有数十亿行）.

我不认为您要找的是在Pytables中实现的。所以你可能得自己做。我的建议是：在两列上都放置一个csi_索引，当您需要以排序方式处理数据时，您需要自己实现迭代。将按一列排序的足够小的位拉入内存，然后进行处理（相对于另一列排序并处理数据）

希望这有帮助