Python scipy距离变换edt函数是如何工作的?

Python scipy距离变换edt函数是如何工作的?,python,matlab,scipy,edt,Python,Matlab,Scipy,Edt,我很难理解欧几里德距离变换函数在Scipy中是如何工作的。据我所知,它与Matlab函数(bwdist)不同。例如,对于输入: [[ 0. 0. 0. 0. 0.] [ 0. 1. 0. 0. 0.] [ 0. 0. 0. 0. 0.] [ 0. 0. 0. 1. 0.] [ 0. 0. 0. 0. 0.]] scipy.ndimage.distance_transform_edt函数返回相同的数组: [[ 0. 0. 0. 0. 0.]

我很难理解欧几里德距离变换函数在Scipy中是如何工作的。据我所知,它与Matlab函数(bwdist)不同。例如,对于输入:

[[ 0.  0.  0.  0.  0.]
 [ 0.  1.  0.  0.  0.]
 [ 0.  0.  0.  0.  0.]
 [ 0.  0.  0.  1.  0.]
 [ 0.  0.  0.  0.  0.]]
scipy.ndimage.distance_transform_edt函数返回相同的数组:

[[ 0.  0.  0.  0.  0.]
 [ 0.  1.  0.  0.  0.]
 [ 0.  0.  0.  0.  0.]
 [ 0.  0.  0.  1.  0.]
 [ 0.  0.  0.  0.  0.]]
但是matlab函数会返回以下结果:

1.4142    1.0000    1.4142    2.2361    3.1623
1.0000         0    1.0000    2.0000    2.2361
1.4142    1.0000    1.4142    1.0000    1.4142
2.2361    2.0000    1.0000         0    1.0000
3.1623    2.2361    1.4142    1.0000    1.4142

这更有意义,因为它将“距离”返回到最近的距离。

文档字符串中不清楚,但计算从非零(即非背景)点到最近零(即背景)点的距离

例如:

In [42]: x
Out[42]: 
array([[0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1],
       [0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1],
       [0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1],
       [0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1]])

In [43]: np.set_printoptions(precision=3)  # Easier to read the result with fewer digits.

In [44]: distance_transform_edt(x)
Out[44]: 
array([[ 0.   ,  0.   ,  0.   ,  0.   ,  0.   ,  1.   ,  2.   ,  3.   ],
       [ 0.   ,  1.   ,  1.   ,  1.   ,  0.   ,  1.   ,  2.   ,  2.236],
       [ 0.   ,  1.   ,  1.414,  1.   ,  0.   ,  1.   ,  1.   ,  1.414],
       [ 0.   ,  0.   ,  1.   ,  1.   ,  0.   ,  0.   ,  0.   ,  1.   ]])
通过将
距离变换
应用于
np.logical\u not(a)
(即反转前景和背景),可以获得与Matlab的
bwdist(a)
等效的值:


沃伦已经解释了距离变换edt的工作原理。 在本例中,可以沿x和y方向更改采样单位

ndimage.distance_transform_edt(a)
array([[ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  1.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  1.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.]])
但是


仅供参考,scipy源代码链接到。我如何使用生成的矩阵计算距离的比率?@mLstudent33,这不是评论的问题。创建一个新问题,展示你正在尝试做什么,到目前为止你已经尝试了什么,等等(即遵循好问题的所有常规指导原则)。
ndimage.distance_transform_edt(a)
array([[ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  1.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  1.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.]])
>>> ndimage.distance_transform_edt(a, sampling=[2,2])
array([[ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  2.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  2.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.]])
ndimage.distance_transform_edt(a, sampling=[3,3])
array([[ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  3.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  3.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.]])