可视化层次/树数据，其中每个节点在R或python中可能有多个父节点

我正在寻找一种可视化分层数据的方法，其中父级和子级之间存在多对多关系-这不是一个树，但应该像树一样分层。在R中是否有一个好的包来做这件事？我已经看了一些，但它们要么用于可视化树，要么用于可视化图形，但我想可视化一个同样具有层次结构的图形

我认为您需要可视化一个有向无环图（DAG）。即，没有循环，但每个节点可能有多个入度和出度。如果设置了正确的参数，图形库通常会正确地显示这些参数。我建议networkx用于中小型图形，或Gephi用于大型图形（Gephi是一个GUI程序，但具有良好的可视化效果）。Networkx的Graphviz绘图后端将很好地绘制DAG

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谢谢斯蒂芬！听起来不错。什么是小型/中型图形？我想可能总共有数千个节点-每个级别上有几百个，7-10个级别。所以R中有一个rgraphviz，rgraphviz和graphviz之间有什么关系吗？graphviz是一组用于布局和渲染图形的unix工具。rgraphviz是graphviz的一个R绑定，有两个Python绑定（由networkx使用）。你可以自己使用graphviz，因为它有一个纯文本输入格式。Graphviz将处理它，但networkx的matplotlib绘图引擎可能有问题。这完全取决于图的连通性。