多处理中的Biopython Entrez请求失败

我正在使用

biopython

，尤其是

Entrez

请求搜索和摘要结果。我想通过多处理来实现并行化，以提高效率，但由于某种原因，

Entrez

禁止我这样做

我尝试了Python的

多处理

包和

pathos.multiprocessing

模块。这两种方法都不起作用，但会给我不同的错误消息。这是我使用pathos.multiprocessing的代码。我在

get_entrez\u esearch\u response（）

中使用了

try

，以观察它是否由于查询而无法读取。结果是，在返回一些

uid

之后，

get\u entrez\u esearch\u response（）

将出现异常，并在while循环中继续打印相同的查询集。我知道NCBI服务器限制了我们每秒的请求查询，但为什么它不从下一秒开始请求呢

来自Bio import Entrez
从pathos.multiprocessing导入处理池
def get_entrez_esearch_响应（查询）：
尽管如此：
尝试：
handle=Entrez.esearch（db=“gds”，term=query）
uid=Entrez.read（句柄）[“IdList”][0]
handle.close（）
返回uid
例外情况除外，如e：
打印（e）
打印（查询）
def get_entrez_esearch_response_parallel（查询）：
将处理池（2）作为p：
uid\u list=p.map（获取搜索响应、查询）
打印（uid\U列表）

---

如果您只运行一个进程，Biopython将遵守NCBI限制-您可以通过设置

Entrez.api_key

将速度从每秒3个请求提高到10个，我同意。那么，你的意思是他们故意限制用户使用多个进程吗？不管是哪种方式，我想我现在会回到单进程。谢谢@方舟里好吧，Biopython为您限制了它，否则NCBI只会因为您误用了他们的服务而拒绝您访问。

#uid1
#uid2
#uid3
#uid4
(GSE99020) AND "gse"[Entry Type]
HTTP Error 429: Too Many Requests
(GSE92593) AND "gse"[Entry Type]
HTTP Error 429: Too Many Requests
(GSE25220) AND "gse"[Entry Type]
HTTP Error 429: Too Many Requests
(GSE92593) AND "gse"[Entry Type]
HTTP Error 429: Too Many Requests