Python 如何在块中迭代两个数据帧

Python 如何在块中迭代两个数据帧,python,pandas,Python,Pandas,对于机器学习任务,我需要处理太大的数据集,这些数据集无法一次全部放入我的内存中,因此我需要将其分解为块。幸运的是,pandas.read_csv有一个参数chunk_size,在该参数中,您可以指定要用于分析的数据量,然后使用for循环分块循环数据集,如下所示: #This example can be found at http://pandas.pydata.org/pandas-docs/dev/io.html In [120]: reader = pd.read_table('tmp.

对于机器学习任务,我需要处理太大的数据集,这些数据集无法一次全部放入我的内存中,因此我需要将其分解为块。幸运的是,pandas.read_csv有一个参数chunk_size,在该参数中,您可以指定要用于分析的数据量,然后使用for循环分块循环数据集,如下所示:

#This example can be found at http://pandas.pydata.org/pandas-docs/dev/io.html

In [120]: reader = pd.read_table('tmp.sv', sep='|', chunksize=4)

In [121]: reader
<pandas.io.parsers.TextFileReader at 0xaa94ad0>

In [122]: for chunk in reader:
   .....:     print(chunk)
   .....: 
   Unnamed: 0         0         1         2         3
0           0  0.469112 -0.282863 -1.509059 -1.135632
1           1  1.212112 -0.173215  0.119209 -1.044236
2           2 -0.861849 -2.104569 -0.494929  1.071804
3           3  0.721555 -0.706771 -1.039575  0.271860
[4 rows x 5 columns]
   Unnamed: 0         0         1         2         3
0           4 -0.424972  0.567020  0.276232 -1.087401
1           5 -0.673690  0.113648 -1.478427  0.524988
2           6  0.404705  0.577046 -1.715002 -1.039268
3           7 -0.370647 -1.157892 -1.344312  0.844885
[4 rows x 5 columns]
   Unnamed: 0         0        1         2         3
0           8  1.075770 -0.10905  1.643563 -1.469388
1           9  0.357021 -0.67460 -1.776904 -0.968914
[2 rows x 5 columns]. 
更新: 所以我尝试了海登的任何解决方案,但当我尝试访问数据的特定部分时,它给了我一个新的错误:

print("getting train set")
train = pd.read_csv(os.path.join(dir,"Train.csv"),chunksize = 200000)
print("getting test set")
test = pd.read_csv(os.path.join(dir,"Test.csv"),chunksize = 200000)
result = []
for chunk in train:
    print("transforming train,test,labels into numpy arrays")
    labels = np.array(train)[:,3]
    train = np.array(train)[:,2]
    test = np.array(test)[:,2]

    print("getting estimator and predictions")
    result.append(stochastic_gradient(train,test))
    print("got everything")
result = np.array(result)
回溯:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\Ano\workspace\final_submission\src\rf.py", line 38, in <module>
    main()
  File "C:\Users\Ano\workspace\final_submission\src\rf.py", line 18, in main
    labels = np.array(train)[:,3]
IndexError: 0-d arrays can only use a single () or a list of newaxes (and a single ...) as an index
回溯(最近一次呼叫最后一次):
文件“C:\Users\Ano\workspace\final\u submission\src\rf.py”,第38行,在
main()
文件“C:\Users\Ano\workspace\final\u submission\src\rf.py”,第18行,主目录
标签=np.数组(列)[:,3]
索引器错误:0-d数组只能使用单个()或新轴列表(以及单个…)作为索引

在for循环中,您可以访问当前范围内的变量:

In [11]: a = [1, 2, 3]

In [12]: b = 4

In [13]: for L in a:  # no need to "and b"
             print L, b
1 4
2 4
3 4
小心,这意味着在for循环中赋值会覆盖变量:

In [14]: for b in a:
             print b
1
2
3

In [15]: b
Out[15]: 3
要同时遍历两个iTerable,请使用zip:

In [21]: c = [4, 5, 6]

In [22]: zip(a, c)
Out[22]: [(1, 4), (2, 5), (3, 6)]
在Python2中,这是一个在内存中计算的列表(在Python3中不是这样)。你可以使用izip,它是迭代器的帮凶

In [23]: from itertools import izip  # in python 3, just use zip

In [24]: for La, Lc in izip(a, c):
             print La, Lb
1 4
2 5
3 6

只要去掉“and test”就行了?@Learner你的意思是在块上而不是火车上调用数组。更好的名字可能有助于避免这个错误(例如train_chunker)。我有点困惑。如果我调用块,我如何区分火车和测试集?你能给我看一个小的代码示例吗?@Learner目前,你正在调用array(train),train是一个chunker(而不是chunk)。我的建议是对train\u chunker中的train\u chunk使用
,…
而不是对train中的chunk使用
Ok,但我仍然无法获得我需要的测试集的块。有什么方法可以让我同时获得列车和测试集的片段,还是我必须在记忆中完整地加载其中一个集?@Learner哦,我明白了!您希望同时遍历这些对象。我想您应该使用zip(
来自itertools import izip
):
对于训练块,在izip中测试块(训练块,测试块):…
In [23]: from itertools import izip  # in python 3, just use zip

In [24]: for La, Lc in izip(a, c):
             print La, Lb
1 4
2 5
3 6