如何在python中选择和上载文件

我正在写一个程序，它会问你用户想要读什么文本文件，然后开始读用户输入的任何文件名。以下是我到目前为止的情况：

import sys
import os
import re

#CHOOSE FILE
print "Welcome to the Parsing Database"
raw_input=raw_input("enter file name to parse: ")

#ASSIGN HEADERS AND SEQUENCES
f=open("raw_input", "r")
header=[]
sequence=[]
string=""
for line in f:
    if ">" in line and string=="":
         header.append(line[:-2])
    elif ">" in line and string!="":
        sequence.append(string)
        header.append(line[:-2])
        string=""
    else:
        string=string+line[:-2]
sequence.append(string)

---

前两行工作，但它说它找不到我输入读取的文件。请帮忙！谢谢。

在我的脑海中，我认为

f=open（“raw\u input”，“r”）

需要

f=open（raw\u input，“r”）

，因为您试图引用变量

raw\u input

中包含的字符串，而不是试图打开名为raw\u input的文件。此外，您可能还应该将变量的名称更改为更可读的名称，因为

raw\u input（）

是代码中使用的函数，也是一个变量，这使得它很难读取。您的代码还有其他特定问题吗？

f=open（“原始输入”，“r”）

“原始输入”是一个普通字符串。您必须将其引用为

raw\u input

另外，如果不使用

.read（）

和

open（）

方法，则不会有任何行，因此无法解析它们。从

raw\u input

提供的文件中读取行可以这样做：

import sys
import os
import re

#CHOOSE FILE
print "Welcome to the Parsing Database"
raw_input_file=raw_input("enter file name to parse: ")

#ASSIGN HEADERS AND SEQUENCES
testfile = open(raw_input_file, "r")
secuence = []
for line in testfile.read().splitlines():
    secuence.append(line)
for i in secuence:
    print i
testfile.close()

---

随时可能解析FASTA文件；）您的错误或具体问题是什么？您不应该使用

raw\u input

作为变量名。此外，您没有询问您具体需要什么帮助，也没有提及您是否有任何错误/障碍。

IOError:[Errno 2]没有这样的文件或目录：“raw\u input”

应该已经告诉您问题所在，您正在尝试打开一个名为“raw\u input”的文件不要使用上面一行的变量。谢谢，这是我的问题，我有引号，它把我弄糊涂了。命名它为raw\u input没有什么问题，因为函数是raw\u input（），当然，最好创建名称空间的变量，如file_raw_input或任何其他未采用的变量。@erm3nda该位更像是上下文建议，因为它看起来OP在区分不同的语法位时遇到了困难（有一种更好的说法）如果您编辑他们的脚本，然后修复原始输入名称仍然不起作用。他需要的不仅仅是一个建议。他们说这解决了他们的问题，所以我认为解决方案是好的。