如何在r包中包含RMarkdown文件？

我正在用R创建一个包，我还想包含一个R标记文件。此RMarkdown模板包含我的包中的函数，并通过knitr呈现为html文档

目标是定期运行一个函数（通过cronjob）来呈现RMarkdown文件，以便生成每周报告

如何将这些文件添加到R包（如.Rmd）中，并在进行函数调用以呈现所述模板时引用.Rmd，特别是因为使用

use\u data（myrmarkdown.Rmd）

将无法获得所需的结果。

创建R包时，将有一个包含以下内容的目录树（除其他外）在包的根目录中：

DESCRIPTION

、

NAMESPACE

和

R/

目录。如果您还有

inst/

目录，则该目录中的所有内容都会逐字复制到包目录中，不包括

inst/

例如，如果包目录如下所示：

+- DESCRIPTION
+- NAMESPACE
+- inst/
|  \- rmd/
|     \- file.Rmd
\- R/
   +- file1.R
   +- file2.R
   \- file3.R

然后，当您构建并安装软件包时，您将在软件包库的以下位置找到：

+- DESCRIPTION
+- INDEX
+- NAMESPACE
+- rmd/
|  \- file.Rmd
\- R/
   +- packagename
   +- packagename.rdb
   \- packagename.rdx

（其他文件/目录是在此过程中创建的，为了简单起见，我将忽略它们。）

您需要知道的最后一条信息是“安装后如何访问此文件？”因为有些系统在不同的目录中安装R库，而且用户经常在个人R库中安装软件包，因此您无法事先知道在何处查看Enter

system.file

：

system.file("rmd", "file.Rmd", package = "packagename")
## [1] "c:/R/R-3.1.3/library/packagename/rmd/file.Rmd"

---

这可以用于整个Rmd文件。我将其用于Rmd呈现文档的公司特定模板。也就是说，我寻找“包含”文件来个性化LaTeX，以便呈现的PDF具有页眉/页脚，并按照我们想要的方式进行样式设置。这一步需要编写一个函数来替换

PDF\u文档

（例如）在Rmd YAML标题中，这一点在中得到了很好的阐述。

我结束了这篇文章，因为它实际上是关于“如何在我的包中包含$FOO”的一系列现有问题中的两个，答案总是“below

inst/

”。@DirkEddelbuettel虽然这对你来说很明显，因为你有更多的结构元知识，下面的答案是精确的我想知道我在找什么，链接的帖子不会回答我的问题。特别是，访问Rmd（不同于简单地调用

data（x）

）是关键。@Danielgan，很高兴它有帮助，但当我们在不同的标签下写x次相同的东西时，网站并没有变得更好。对于这一点，答案基本上是肯定的“使用

system.file（）

”——所以只要尝试一下

system.file（“doc”，“knitr intro.Rmd”，package=“knitr”）

，无论您在何处以及如何安装knitr，它都会为您提供文件的完整路径——因为它来自

inst/doc/knitr intro.Rmd

，然后R就可以计算这些东西。这是非常有文档记录的（如果一开始很难找到）。我投票重新打开，因为1）此用例不同于重复的用例，因为文件必须通过

路径访问，而不是使用
数据（）
，2）链接问题的答案模糊不清，过分依赖于阅读外部来源。虽然阅读链接答案建议的来源可能会帮助你找出该做什么，但他们肯定不会回答这个问题。非常感谢@r2evans，这非常有帮助，正是我要找的答案，谢谢！@Konrad，我不知道在编辑过程中（我喜欢它的直截了当），但我在windows上使用正斜杠甚至混合斜杠从来没有遇到过问题，而且正斜杠对于其他所有操作系统都是正确的答案（我使用过R）。一旦我了解到windows的R可以很好地使用正斜杠，我就很少在路径中使用反斜杠（并且经常超越
fsep=“/”
@r2evans知道这一点很好，我认为这可能会有问题，因此，如果您从未遇到过任何问题，我可能是错的。我总是尝试使用
file.path
，只是为了安全起见，但可能过于谨慎