R 将BED文件转换为WIG文件
你知道有什么方法可以轻松地(通过R或其他程序)将BED文件转换为WIG吗 你能给我一些指导吗?看看这个软件包,特别是下面的手册页:R 将BED文件转换为WIG文件,r,bioinformatics,bed,R,Bioinformatics,Bed,你知道有什么方法可以轻松地(通过R或其他程序)将BED文件转换为WIG吗 你能给我一些指导吗?看看这个软件包,特别是下面的手册页: ?import ?export 下面是一个具体示例,说明如何将.bed转换为.wig。正如@Paolo所暗示的,这是一个直截了当的过程: library(rtracklayer) #bioconductor bed_loaded <- import(con="~/Downloads/my_bed.bed.gz", format="bed") #no n
?import
?export
下面是一个具体示例,说明如何将
.bed
转换为.wig
。正如@Paolo所暗示的,这是一个直截了当的过程:
library(rtracklayer) #bioconductor
bed_loaded <- import(con="~/Downloads/my_bed.bed.gz", format="bed") #no need to unzip .gz
# bed_loaded <- import.bed(con="~/Downloads/my_bed.bed") #if you unzip
export.wig(object=bed_loaded, con="~/Downloads/bed2wig.wig")
library(rtracklayer)#生物导体
bed_加载谢谢…你知道有没有办法将床上图形转换为bed???如何做到这一点?对于生物信息学相关的问题,我建议你发表在。比如这个问题。