R 将BED文件转换为WIG文件

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你知道有什么方法可以轻松地(通过R或其他程序)将BED文件转换为WIG吗

你能给我一些指导吗?

看看这个软件包,特别是下面的手册页:

 ?import
 ?export

下面是一个具体示例,说明如何将
.bed
转换为
.wig
。正如@Paolo所暗示的,这是一个直截了当的过程:

library(rtracklayer) #bioconductor

bed_loaded <- import(con="~/Downloads/my_bed.bed.gz", format="bed") #no need to unzip .gz
# bed_loaded <- import.bed(con="~/Downloads/my_bed.bed") #if you unzip 

export.wig(object=bed_loaded, con="~/Downloads/bed2wig.wig")
library(rtracklayer)#生物导体

bed_加载谢谢…你知道有没有办法将床上图形转换为bed???如何做到这一点?对于生物信息学相关的问题,我建议你发表在。比如这个问题。