R 定义'；条件'；DESeq2中的变量

我正在尝试使用DESeq2

定义条件变量时，我在将输入转换为因子时遇到问题

我的输入是从excel导入的电子表格中的TIBLE

condition<-Samples1[,9]

当我尝试转换为因子时，我得到：

> factor<-factor(condition)
> factor
Ever Use Tobacco (1=N, 2=Y) 
                       <NA> 
Levels: c("N", "Y")

>因子
曾经使用过烟草（1=N，2=Y）
级别：c（“N”、“Y”）

我为DESeq2找到的另一种方法也不起作用：

> conditionc<-factor(c(condition))
> conditionc
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              Ever Use Tobacco (1=N, 2=Y) 
c("N", "Y", "N", "N", "N", "N", "N", "N", "Y", "N", "N", "N", "N", "Y", "Y", "Y", "N", "N", "N", "N", "Y", "N", "Y", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "N", "Y", "N", "N", "N", "Y", "N", "N", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "N", "Y", "N", "N", "N", "N", "N", "N", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "N", "N", "N", "Y", "N", "N", "Y", "N", "N", "Y", "N", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "Y", "Y", "N", "Y", "N") 
Levels: c("N", "Y", "N", "N", "N", "N", "N", "N", "Y", "N", "N", "N", "N", "Y", "Y", "Y", "N", "N", "N", "N", "Y", "N", "Y", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "N", "Y", "N", "N", "N", "Y", "N", "N", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "N", "Y", "N", "N", "N", "N", "N", "N", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "N", "N", "N", "Y", "N", "N", "Y", "N", "N", "Y", "N", "N", "N", "Y", "Y", "N", "N", "Y", "Y", "Y", "N", "Y", "N")
> 

>条件
曾经使用过烟草（1=N，2=Y）
c（“N”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“Y”、“Y”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“Y”、“N”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“Y”、“Y”、“Y”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“Y”、“N”、“N”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“，“N”，“Y”，“N”，“N”，“N”，“N”，“N”，“N”，“Y”，“Y”，“N”，“N”，“N”，“Y”，“Y”，“Y”，“Y”，“N”，“N”，“Y”，“N”）
级别：c（“N”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“Y”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“Y”、“Y”、“Y”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”、“N”“Y”、“N”、“N”、“Y”、“N”、“N”、“Y”、“N”、“N”、“Y”、“Y”、“Y”、“N”、“N”、“N”、“Y”、“Y”、“Y”、“N”、“Y”、“Y”、“N”、“Y”、“N”、“N”、“Y”、“N”）
> 

数据应如下所示：

>条件
[1] ctl ctl ctl exp exp exp
级别：ctl exp

---

有人能解释一下我做错了什么吗？

原因是

条件

是一个

tibble/data.frame

，只有一列。我们需要将

因子

中的

x

提取为向量，根据

？因子

为

x-数据向量，通常采用少量不同的值

我们可以使用

[[

factor(condition[[1]]) # // extract the first column

或

取消列表

factor(unlist(condition))

或使用列名进行提取

factor(condition$`Ever Use Tobacco (1=N, 2=Y)`)

---

原因是

条件

是一个带有单列的

tibble/data.frame

。我们需要根据

提取
因子
中的
x
作为向量

x-数据向量，通常采用少量不同的值

我们可以使用
[[

factor(condition[[1]]) # // extract the first column

或
取消列表

factor(unlist(condition))

或使用列名进行提取

factor(condition$`Ever Use Tobacco (1=N, 2=Y)`)