R 将列表与do.call组合,同时保留行中列表的每个条目

R 将列表与do.call组合,同时保留行中列表的每个条目,r,list,cbind,do.call,R,List,Cbind,Do.call,如果以前有人问过这个问题,请原谅我 我有多个列表,我希望合并如下 A <- list(c("R", "L", "*", "T", "M", "S", "S", "S", "S", "Y"), c("G", "A", "G", "P", "P", "V", "P"), c("E", "G", "R", "E", "Q", "T", "K", "G", "S", "G"), c("Y", "N", "N", "D", "W"), c("T", "K")) B <

如果以前有人问过这个问题,请原谅我

我有多个列表,我希望合并如下

A <- list(c("R", "L", "*", "T", "M", "S", "S", "S", "S", "Y"), 
  c("G", "A", "G", "P", "P", "V", "P"), 
  c("E", "G", "R", "E", "Q", "T", "K", "G", "S", "G"), 
  c("Y", "N", "N", "D", "W"), 
  c("T", "K"))

B <- list(c("G", "T", "Q", "R"), 
  c("T", "G", "L", "W", "D", "Y", "*", "L", "Q", "H", "A", "P", "H", "L", "H", "L"), 
  c("E", "E", "D", "A", "G", "G", "R", "E", "D", "S", "I", "L", "V", "N", "G", "A", "T", "P", "\"", "\"", "C", "S", "D", "Q", "S", "S", "D", "S", "P", "P", "I", "L", "E", "A", "I", "R"), 
  c("S", "M", "C", "G", "*", "I", "K", "P"), 
  c("D", "S", "P"))

C <- list(c("G", "L", "V", "L", "A", "H", "L", "R", "R", "L", "G"), 
  c("G", "S", "D", "T", "P", "V", "M", "P", "K", "L", "F"), 
  c("N", "W", "F", "E", "N", "T", "F", "D", "F", "R", "N", "K", "R", "C", "K", "*", "V"), 
  c("P", "A", "T", "R", "S", "L", "R", "R", "R", "A", "T", "A"), 
  c("I", "G", "F", "I", "P", "S", "P", "L", "R"))
我尝试了以下方法,但这会将列表中的每个字符放在不同的行上,相当于每个列表的不同行数:

do.call(cbind, list(A,B,C))
有办法得到我想要的吗


Thx

我们可以通过嵌套的
sapply
来循环
列表

 m1 <- sapply(list(A, B, C), function(x) sapply(x, paste, collapse=""))
 setNames(as.data.frame(m1), LETTERS[1:3])

m1这里有一个基本的R方法

data.frame(do.call(mapply,
                   list(function(x) sapply(x, paste, collapse=""), list(A=A, B=B, C=C))))
这是回报

           A                                    B                 C
1 RL*TMSSSSY                                 GTQR       GLVLAHLRRLG
2    GAGPPVP                     TGLWDY*LQHAPHLHL       GSDTPVMPKLF
3 EGREQTKGSG EEDAGGREDSILVNGATP""CSDQSSDSPPILEAIR NWFENTFDFRNKRCK*V
4      YNNDW                             SMCG*IKP      PATRSLRRRATA
5         TK                                  DSP         IGFIPSPLR
这里,
do.call
应用
Map
。第二行中的列表是Map的参数,它在列表的命名列表上应用
sapply
sapply
粘贴每个列表项的向量并返回向量

注:

  • 这是试图复制亚历克西斯·拉兹(alexis laz)早些时候向我展示的方法
  • 我最初使用的是
    Map
    ,但根据
    microbenchmark
    的数据,
    mappy
    似乎快了大约33%(344ms vs.513ms)

  • 如果您想使用
    tidyverse
    函数,您可以这样做

    library(tidyverse)
    lst(A,B,C) %>% map_df(map_chr, paste, collapse="")
    

    lst()
    函数允许用户创建列表并保留变量名。然后我们对列进行
    map()
    操作,在每列中,对字符向量列表进行
    map()
    操作并折叠它们。

    方法不错。我之前试过使用嵌套贴图,但不知怎么的,它无法工作。
    library(tidyverse)
    lst(A,B,C) %>% map_df(map_chr, paste, collapse="")