R：如何更改矩阵数组？

我有一个矩阵，比如：

"aaa" 28
"aac" 8
"aag" 20

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我想用K替换aaa，用N替换aac，用K替换aag。如何使用R来实现这一点？

这里有很多选项。不幸的是，你没有表现出任何努力来解决问题，甚至没有表现出清晰和可复制性。例如，使用ifelse：

编辑 如果我想用K替换aaa，用N替换aac，用G替换aag：

dat$V1 <- with(dat,ifelse(V1 == 'aaa',
                          'K',
                          ifelse(V1=='aac','N','G')))
 dat
  V1 V2
1  K 28
2  N  8
3  G 20

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这可能更接近于您想要做的事情：

 ## if necessary, install the package first:
 ##  source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
 ##  biocLite("Biostrings")
 library(Biostrings)
 d <- data.frame(string=c("aaa","aac","aag"),count=c(28,8,20))
 tfun <- function(x) as.character(translate(DNAString(x)))
 transform(d,aa=sapply(string,tfun))
 ##   string count aa
 ## 1    aaa    28  K
 ## 2    aac     8  N
 ## 3    aag    20  K

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将第一列定义为向量，然后使用$进行替换，但我没有成功。我对您的新示例aag->G有点困惑；如果你能给出一些关于生物信息学目标的背景，也许Biostrings包可以很容易地做到…@agstudy:我试着简单地问我的问题。如果我想用K替换aaa，用N替换aac，用G替换aag，我应该如何更改代码？@Toobabassi Daloii我编辑我的答案。@Ben Bolker:你说得对，但我想在没有任何生物化学软件包的情况下这样做。只是出于好奇，为什么？@Ben Bolker:这是我项目的一部分

 ## if necessary, install the package first:
 ##  source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
 ##  biocLite("Biostrings")
 library(Biostrings)
 d <- data.frame(string=c("aaa","aac","aag"),count=c(28,8,20))
 tfun <- function(x) as.character(translate(DNAString(x)))
 transform(d,aa=sapply(string,tfun))
 ##   string count aa
 ## 1    aaa    28  K
 ## 2    aac     8  N
 ## 3    aag    20  K

 transform(d,string=sapply(string,tfun))