将图形直接放入Knitr文档（不将其文件保存在文件夹中）第3部分

我将延续我先前提出的两个问题：

我正在编写一个R包，它为输出数据摘要的用户生成一个.pdf文件。我在包中有一个.Rnw脚本（这里，我的MWE称为test.Rnw）。用户可以执行以下操作：

knit2pdf("test.Rnw", clean=T)

这使得这个过程对他们来说很容易，因为它会自动从.tex文件创建.pdf文件，并为他们删除不必要的文件（.aux和.log，例如）。它还将所有图像存储到一个临时目录中（使用tempdir（）），在将它们合并到.tex和.pdf文件中后，系统将定期擦除该临时目录。这意味着他们也不必擦除图像文件

以下是我的测试。Rnw MWE：

\documentclass[nohyper]{tufte-handout}
\usepackage{tabularx} 
\usepackage{longtable}

\setcaptionfont{% changes caption font characteristics
  \normalfont\footnotesize
  \color{black}% <-- set color here
}

\begin{document}

<<setup, echo=FALSE>>=
  library(knitr)
library(xtable)
library(ggplot2)
# Specify directory for figure output in a temporary directory
temppath <- tempdir()
opts_chunk$set(fig.path = temppath)
@

  <<diamondData, echo=FALSE, fig.env = "marginfigure", out.width="0.95\\linewidth", fig.cap = "The diamond dataset has varibles depth and price.",fig.lp="mar:">>=
  print(qplot(depth,price,data=diamonds))
@

  <<echo=FALSE,results='asis'>>=
  myDF <- data.frame(a = rnorm(1:10), b = letters[1:10])
print(xtable(myDF, caption= 'This data frame shows ten random variables from the distribution and a corresponding letter', label='tab:dataFrame'), floating = FALSE, tabular.environment = "longtable", include.rownames=FALSE)
@

  Figure \ref{mar:diamondData} shows the diamonds data set, with the
variables price and depth.Table \ref{tab:dataFrame} shows letters a through j
corresponding to a random variable from a normal distribution.

\end{document}

在任何情况下，我都试图将此包提交给CRAN，但遇到了两个问题：

1） 首先，更令人困惑的问题是：上面的MWE代码似乎在Mac系统上工作，但在Windows系统上似乎不工作！在Windows上，生成的.pdf文件不包含图像。排除故障后，我想我已经解决了问题，但仍然找不到解决方案

基本上，在Windows上，tempdir（）命令似乎会创建带有双反斜杠的路径，例如\\this\\is\\myPath。然后，在.tex文件中，临时目录（包含图像）的路径是单反斜杠，例如\this\is\myPath。但是，这些应该是单正斜杠，例如/this/is/myPath，以便.tex文件查找存储在临时目录中的图像

事实上，如果我在Windows中手动将.tex文件中的反斜杠更改为正斜杠，那么我可以成功地将其转换为成功包含图像的.pdf文件

然而，我不确定如何用我的语法解决这个问题。我认为这将是一个简单的解决方案，但如果我简单地执行以下操作：

# Specify directory for figure output in a temporary directory
temppath <- tempdir()
gsub("\\\\", "/", temppath)

这样.tex文件也可以自动擦除。我试图确认这样的语法在CRAN标准中是可以接受的，因为它确实涉及到从用户的计算机上删除一个文件（这可能看起来像危险/恶意软件），尽管它特别指向它刚刚生成的.tex文件，因此它不应该删除对他们来说重要的任何内容

---

*注意：默认情况下，我会删除所有中间文件，因此用户只处理.pdf文件。但是，我仍然允许用户选择违反此默认设置，并保留这些中间文件（如果需要）。

您提供的代码对特定于Swave的表达式给出了一个尖锐的警告：

\SwaveOpts{concordance=TRUE}

如果我删除此选项，页面将为我编译（有许多框错误）并在Windows（和Ubuntu）中生成带有图形的PDF

我也不清楚为什么您首先要指定自己的临时目录：

knitr

不帮您处理这个吗

我刚安装了MikTex并对其进行了更新（许多软件包在安装后都有4到5年的历史）

我尝试了R-devel和R-3.2.2：

> sessionInfo()
R version 3.2.2 (2015-08-14)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                           LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] ggplot2_1.0.1 xtable_1.7-4  knitr_1.11   

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.0      digest_0.6.8     MASS_7.3-44      grid_3.2.2       plyr_1.8.3       gtable_0.1.2     formatR_1.2     
 [8] magrittr_1.5     evaluate_0.7.2   scales_0.3.0     stringi_0.5-5    reshape2_1.4.1   labeling_0.3     proto_0.3-10    
[15] tools_3.2.2      stringr_1.0.0    munsell_0.4.2    colorspace_1.2-6

sessionInfo()
R Under development (unstable) (2015-09-27 r69432)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                           LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] ggplot2_1.0.1 xtable_1.7-4  knitr_1.11   

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.0      digest_0.6.8     MASS_7.3-44      grid_3.3.0       plyr_1.8.3       gtable_0.1.2     formatR_1.2     
 [8] magrittr_1.5     evaluate_0.7.2   scales_0.3.0     stringi_0.5-5    reshape2_1.4.1   labeling_0.3     proto_0.3-10    
[15] tools_3.3.0      stringr_1.0.0    munsell_0.4.2    colorspace_1.2-6

---

normalizePath（tempdir（），winslash='/'）是否有帮助？在r会话结束后，
tempdir
中存储的任何内容都将被删除，因此不需要明确删除任何内容。但是您可以
？取消链接
上的文件
。退出函数的
，cran可能更喜欢运行系统命令。我只是想说，这个版本的问题在问题质量和清晰度方面比第2部分有了很大改进！
knit2pdf("/inst/Rnw/test.Rnw","/path/test.tex",clean=T)
system(sprintf("%s", paste0("rm -r ", "/path/myFile.tex")))

> sessionInfo()
R version 3.2.2 (2015-08-14)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                           LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] ggplot2_1.0.1 xtable_1.7-4  knitr_1.11   

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.0      digest_0.6.8     MASS_7.3-44      grid_3.2.2       plyr_1.8.3       gtable_0.1.2     formatR_1.2     
 [8] magrittr_1.5     evaluate_0.7.2   scales_0.3.0     stringi_0.5-5    reshape2_1.4.1   labeling_0.3     proto_0.3-10    
[15] tools_3.2.2      stringr_1.0.0    munsell_0.4.2    colorspace_1.2-6

sessionInfo()
R Under development (unstable) (2015-09-27 r69432)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                           LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] ggplot2_1.0.1 xtable_1.7-4  knitr_1.11   

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.0      digest_0.6.8     MASS_7.3-44      grid_3.3.0       plyr_1.8.3       gtable_0.1.2     formatR_1.2     
 [8] magrittr_1.5     evaluate_0.7.2   scales_0.3.0     stringi_0.5-5    reshape2_1.4.1   labeling_0.3     proto_0.3-10    
[15] tools_3.3.0      stringr_1.0.0    munsell_0.4.2    colorspace_1.2-6