R 为绘图中选定的社区指定颜色
在一个情节中,我需要给两个特定的社区涂上颜色。以以下数据帧为例:R 为绘图中选定的社区指定颜色,r,plot,igraph,R,Plot,Igraph,在一个情节中,我需要给两个特定的社区涂上颜色。以以下数据帧为例: A B C D E F G A 0 1 0 1 0 1 0 B 1 0 1 1 0 1 0 C 0 1 0 0 0 0 0 D 1 1 0 0 1 1 0 E 0 0 0 1 0 1 0 F 1 1 0 1 1 0 1 G 0
A B C D E F G
A 0 1 0 1 0 1 0
B 1 0 1 1 0 1 0
C 0 1 0 0 0 0 0
D 1 1 0 0 1 1 0
E 0 0 0 1 0 1 0
F 1 1 0 1 1 0 1
G 0 0 0 0 0 1 0
ob <- read.csv("...ties.csv",sep = ",", header = TRUE, row.names = 1)
m <- as.matrix(ob)
g <- graph.adjacency(m, mode="undirected", weighted = T, add.rownames = T)
此操作生成许多社区,如com[[1]]、com[[2]]等。我使用以下代码绘制生成的图形(每个社区一种颜色):
plot(g, vertex.color=membership(com))
现在,我如何仅为两个选定的社区着色,例如com[[1]]和com[[2]],以保持其余节点的同质性?我必须调整邻接矩阵,以便显示多个社区
library(igraph)
ob <- read.table(text="
A B C D E F G
A 0 1 0 1 0 1 0
B 1 0 1 1 0 1 0
C 0 0 0 0 0 0 0
D 1 1 0 0 1 0 0
E 0 0 0 1 0 1 1
F 0 1 0 0 1 0 1
G 0 0 0 0 1 1 0", header=TRUE)
m <- as.matrix(ob)
g <- graph.adjacency(m, mode="undirected", weighted = T, add.rownames = T)
com <- edge.betweenness.community(g)
V(g)$memb <- com$membership
cols <- membership(com)
cols[cols!=3] <- 1
plot(g, vertex.color=cols)
库(igraph)
ob我不得不调整你的邻接矩阵,这样就出现了一个以上的社区
library(igraph)
ob <- read.table(text="
A B C D E F G
A 0 1 0 1 0 1 0
B 1 0 1 1 0 1 0
C 0 0 0 0 0 0 0
D 1 1 0 0 1 0 0
E 0 0 0 1 0 1 1
F 0 1 0 0 1 0 1
G 0 0 0 0 1 1 0", header=TRUE)
m <- as.matrix(ob)
g <- graph.adjacency(m, mode="undirected", weighted = T, add.rownames = T)
com <- edge.betweenness.community(g)
V(g)$memb <- com$membership
cols <- membership(com)
cols[cols!=3] <- 1
plot(g, vertex.color=cols)
库(igraph)
ob向我们展示你的数据的可复制示例。我现在添加了一个。这有帮助吗?给我们展示你的数据的可复制的例子。我现在添加了一个。这有用吗?谢谢你。1和3在代码中是什么意思?成功了,但我不确定到底发生了什么。在我的真实矩阵中,我有37个社区。如何为多个选定社区着色?cols[cols!=3]谢谢。1和3在代码中是什么意思?成功了,但我不确定到底发生了什么。在我的真实矩阵中,我有37个社区。如何为多个选定社区着色?cols[cols!=3]