如何为walktrap社区中的每个分区提取模块性分数?
我是社区检测的新手,为了让事情变得更难,我也是R的初学者-请在回答时记住这一点。 如果有人能告诉我如何做到这一点,我很高兴将我的数据添加到这篇文章中 第一个问题 我创建了一个有向图,其中包含2198个节点和1380771条带权重的边(权重包含在MyLink中): 我可以绘制一个树状图,上面有10个社区:如何为walktrap社区中的每个分区提取模块性分数?,r,plot,graph,modularity,R,Plot,Graph,Modularity,我是社区检测的新手,为了让事情变得更难,我也是R的初学者-请在回答时记住这一点。 如果有人能告诉我如何做到这一点,我很高兴将我的数据添加到这篇文章中 第一个问题 我创建了一个有向图,其中包含2198个节点和1380771条带权重的边(权重包含在MyLink中): 我可以绘制一个树状图,上面有10个社区: dendrogram <- dendPlot(com, mode="hclust") 树状图 com <- walktrap.community(net, weights = E
dendrogram <- dendPlot(com, mode="hclust")
树状图
com <- walktrap.community(net, weights = E(net)$weight, steps = 4, merges =
TRUE, modularity = TRUE)
length(com) # number of communities: 10
modularity(com) # how modular the graph partitioning is
dendrogram <- dendPlot(com, mode="hclust")
com_plot <- plot(com, net)