如何将R变量从一个shell脚本重用到另一个shell脚本？

我有一个R管道在一个大数据集上运行分析。目前，我可以通过从终端调用脚本来启动分析，并为其提供分析参数。

$。/my_script.R--参数1 a1--参数2 b1

脚本从

.Rds

文件加载数据集，但每次启动脚本都需要一分钟以上的时间来加载

是否有一种方法可以将数据集保存在内存中，以便在一行中运行多个分析（意思是

$./my_script.R--parameter1 a2--parameter2 b2

等）？也许可以利用全球环境？

---

谢谢

解决该问题的一种方法是允许用户在脚本调用时指定多对参数，以便程序可以一次迭代所有参数（只需要一次启动成本）

下面是一个示例脚本，它使用了一些东西：

库（optpass）

，以便于参数设置。还有其他的，什么都不需要，我发现这让事情看起来很容易

脚本能够知道它是源代码（而不是运行一些代码，对开发/测试很有用）还是从命令行运行（这将触发一些代码运行）。这类似于python的

if uuuu name uuuuu=='uuu main uuuu'：

技巧，我刚才回答为

它们都不是严格必需的，但我发现它有助于演示如何构造脚本，以便您可以方便地执行“一个或多个”类型操作

#/usr/bin/env r
启动您的意思是，在bash提示符下，您调用
/my_script.R..
，当它完成时，您将返回bash提示符并希望运行相同的（或不同的）脚本R脚本并使该数据保持驻留状态以便第二个R实例重用？@r2evans是的，就是这样。问题在于：当
myscript.R
完成时，R退出。它为计算而请求和分配的内存（以及保存
.Rds
文件内容的内存）已被释放并返回到操作系统。如果希望/需要R对象驻留在内存中，则必须以某种方式保持R处于活动状态，这可能与使用多个（不同）脚本文件的这种方法不兼容。使用驻留内存保持某种形式的R的一种方法是提供某种形式的R服务，这种服务可能会有光泽（不太适合此场景），
管道工
，或
Rserve
。每种方法都有优点和缺点，它们都有缺点（例如，学习曲线、运行过程的开销、配置、身份验证、状态管理等）。改进整个过程的一种方法是：不提供
--param1 a1--param2 b1
，而是允许在单个调用中进行多次迭代。例如，您可能支持类似于args的
--param1
（当前功能不变），但也可以添加一个选项
--params csv somefile.csv
，其中csv文件是一个2列csv，包含1对或多对
a1、b1
，每行执行一次。您的脚本需要调整以适应此迭代，但在加载一次后，您可以将大型ish
.Rds
保持在常驻状态。