有没有办法在R(Phyr和MuMin软件包)中挖掘PGLMM_比较模型?
我正在做一个比较分析,我的反应变量是0或1,因此我需要用二项误差分布做一个系统发育校正分析。我使用phyr包()中的PGLMM_compare函数创建了一个包含所有变量的完整模型,但MuMin不支持将此输出作为“全局模型”,因此我无法对其进行挖掘。我正在寻找一种方法,以找到最好的模型,并可能从这些执行模型平均,但似乎这些软件包是不兼容的。手工创建所有模型是很困难的,因为我有8个解释变量。有没有办法挖掘出具有二项式误差结构的系统发育模型?提前感谢。您需要至少为有没有办法在R(Phyr和MuMin软件包)中挖掘PGLMM_比较模型?,r,phylogeny,mumin,R,Phylogeny,Mumin,我正在做一个比较分析,我的反应变量是0或1,因此我需要用二项误差分布做一个系统发育校正分析。我使用phyr包()中的PGLMM_compare函数创建了一个包含所有变量的完整模型,但MuMin不支持将此输出作为“全局模型”,因此我无法对其进行挖掘。我正在寻找一种方法,以找到最好的模型,并可能从这些执行模型平均,但似乎这些软件包是不兼容的。手工创建所有模型是很困难的,因为我有8个解释变量。有没有办法挖掘出具有二项式误差结构的系统发育模型?提前感谢。您需要至少为挖泥船和模型.avg实施以下方法才能与
挖泥船
和模型.avg实施以下方法才能与pglmm\u compare
一起使用:
nobs.pglmm_比较(对象,…)
logLik.pglmm_比较(对象,…)
系数pglmm_比较(对象,…)
可系数。pglmm_比较(模型,…)