R 如何将数据帧转换为二进制数（1和0）？

所以我有一些基因表达计数数据，列中包含我所有的样本，每行包含约60000个基因。我已经将数据转换为TPM，我想排除TPM阈值5以下的某些基因。为此，我需要使用

df[df>5]将TPM值>5转换为1。这是否有效：

data.frame(cbind(df[1],apply(df[-1],2,function(x) +(x > 5))))
    gene SampleA SampleB
1 Gene 1       1       1
2 Gene 2       0       1
3 Gene 3       1       0

一个整洁的选择

library(dplyr)

mutate(df, across(-Gene, ~ + (. > 5)))

# # A tibble: 3 x 3
#   Gene   `Sample A` `Sample B`
#   <chr>       <int>      <int>
# 1 Gene 1          1          1
# 2 Gene 2          0          1
# 3 Gene 3          1          0

库（dplyr）
突变（df，跨（-Gene，~+（.>5）））
##tibble:3 x 3
#基因`样本A``样本B`
#                
#1基因1
#2基因2 0 1
#3基因3110

资料

df您能分享一下输入表的例子吗？但是根据你的描述，我认为一个简单的
ifelse
可以工作吗
df$column\u name=ifelse（df$column\u name>5,1，ifelse（df$column\u name<5,0，df$column\u name）
这很有效，谢谢
library(dplyr)

mutate(df, across(-Gene, ~ + (. > 5)))

# # A tibble: 3 x 3
#   Gene   `Sample A` `Sample B`
#   <chr>       <int>      <int>
# 1 Gene 1          1          1
# 2 Gene 2          0          1
# 3 Gene 3          1          0

df <- structure(list(Gene = c("Gene 1", "Gene 2", "Gene 3"), `Sample A` = c(10.23, 
2.89, 9.66), `Sample B` = c(11.2, 6.76, 4.34)), row.names = c(NA, 
-3L), class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame"))