无法在windows 10的Rstudio中编译rstan或Rcpp代码

我无法在Windows上编译

Rcpp

或

rstan

代码

当我试图编译

rstan

程序（如下）时，我收到了错误

编译代码中出现错误（f，代码，语言=语言，详细=详细） : 在C:/Users/thean/AppData/Local/Temp/Rtmp0kEsrn/downloaded_packages/rJava_0.9-13.zip/Rcpp/include/RcppCommon.h:29中包含的文件中， 从…起 C:/Users/thean/AppData/Local/Temp/Rtmp0kEsrn/downloaded_packages/rJava_0.9-13.zip/Rcpp/include/Rcpp.h:27

从文件18045ECF22E4.cpp:7:C:/Users/thean/AppData/Local/Temp/Rtmp0kEsrn/downloaded_packages/rJava_0.9-13.zip/Rcpp/include/Rcpp/r/headers.h:71:10： 致命错误：R.h:没有这样的文件或目录#include
^~~~~编译已终止。生成：*** [C:/PROGRA~1/R/R-40~1.1/etc/x64/Makeconf:229:file18045ecf22e4.o] 错误1

如果我尝试在

Rstudio

中运行以下命令，它会重新下载Rtools，但已经下载了

library(Rcpp); evalCpp("2+2") 

跑步

Sys.which("make") 
"C:\\rtools40\\usr\\bin\\make.exe" 

此外，当我在命令窗口中运行Sys.which（“make”）时，它只有

“

，而不是“C:\rtools40\usr\bin\make.exe”。当我运行

库（Rcpp）时；evalCpp（“2+2”）

它生成此踏板的原始错误

---

最初的问题与试图编译rstan程序时收到错误有关

我正在使用下面的代码

library(StanHeaders)

library(rstan) 
values = list(y = rnorm(1000,5,3)) 

model =" 

data { 
real y[1000]; 
} 

parameters { 
real mu; 
real sigma; 
} 

model { 
mu    ~ normal(0,10);   
sigma ~ normal(0,10);  
y     ~ normal(mu,sigma); 
} 
" 

fit <- stan(model_code = model, data = values, warmup = 500, iter = 1000, 
chains = 4, cores = 2, thin = 1) 
posterior = extract(fit) 

---

由于没有提及，这可能只是一个路径问题

将Rtools放到路径上

安装完成后，您需要再执行一个步骤才能编译R包：您需要将Rtools make实用程序（bash、make等）的位置放在路径上

尝试在R控制台中执行一次以下命令：

writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")

---

这是最后一步。

是否安装了rtools？27指打印的错误中引用的

Rcpp.h

中的行号@user20650的重点可能是您需要关注的地方，不过（rtools）欢迎使用堆栈溢出。如果您使用的是R4.x，请从此处安装RTools:。如果您仍在使用R3.x，则可能需要添加可从Rtools 4.0获取的Rtools35.exe，而我使用的是Rstudio而不是R，并且仍然收到相同的错误消息。@JonBurksJr；您能否确认已将路径设置为Rtools。您能否确认

库（Rcpp）；evalCpp（“2+2”）

请进行评估。感谢您展示这一点。op确实确认了

Sys.which（“make”）

指向rtools

make

可执行文件，这表明它确实已被添加到路径@user20650，

Sys。根据最初的帖子，which（“make”）

是“”，这使得我的答案非常可信。@Jon，你试着检查一下这是否有帮助吗？有兴趣知道；）

> R version 4.0.1 (2020-06-06) Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
> Running under: Windows 10 x64 (build 18362)
> 
> Matrix products: default
> 
> locale: [1] LC_COLLATE=English_United States.1252 
> LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United
> States.1252 [4] LC_NUMERIC=C                          
> LC_TIME=English_United States.1252    
> 
> attached base packages: [1] stats     graphics  grDevices utils    
> datasets  methods   base     
> 
> other attached packages: [1] rstan_2.21.2         ggplot2_3.3.2       
> StanHeaders_2.21.0-6 Rcpp_1.0.5          
> 
> loaded via a namespace (and not attached):  [1] compiler_4.0.1    
> pillar_1.4.6       prettyunits_1.1.1  remotes_2.2.0      tools_4.0.1  
> pkgbuild_1.1.0      [7] jsonlite_1.7.0     lifecycle_0.2.0   
> tibble_3.0.3       gtable_0.3.0       pkgconfig_2.0.3    rlang_0.4.7  
> [13] cli_2.0.2          rstudioapi_0.11    curl_4.3          
> parallel_4.0.1     loo_2.3.1          gridExtra_2.3      [19]
> withr_2.2.0        dplyr_1.0.2        generics_0.0.2     vctrs_0.3.4  
> stats4_4.0.1       grid_4.0.1         [25] tidyselect_1.1.0  
> glue_1.4.2         inline_0.3.15      R6_2.4.1          
> processx_3.4.3     fansi_0.4.1        [31] callr_3.4.3       
> purrr_0.3.4        magrittr_1.5       codetools_0.2-16  
> matrixStats_0.56.0 scales_1.1.1       [37] ps_1.3.4          
> ellipsis_0.3.1     assertthat_0.2.1   colorspace_1.4-1   V8_3.2.0     
> RcppParallel_5.0.2 [43] munsell_0.5.0      crayon_1.3.4

writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")