如何使用R读取位于linux服务器上的文件

我有一个CSV文件，我想处理它，我试着用这个代码读取它

d = read.table( pipe( 'ssh don@140.184.134.189 "cat cluster.csv"' ), header = T )

但我没有得到任何结果，并得到以下信息：

“读取表中出错”

没有询问我的密码

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另外，如何运行位于同一服务器上的R脚本fes.R

您可以采取不同的方法，在远程linux机器上安装Rstudio服务器

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通过设置ssh密钥对，并将公钥添加到服务器上的~/.ssh/authorized_keys文件中，可以避免密码问题

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您可以在此处看到如何从命令行运行R脚本：

您可以先尝试此操作，然后继续执行以下命令行：

> d <- read.table(pipe('ssh -l don 140.184.134.189 "cat cluster.csv"'))
don@140.184.134.189 password: # type password here

在这里，您应该用本地SSH密钥的密码替换“PASSPHRASE”

要检查的另一件事是“cluster.csv”是否真的是远程服务器上文件的正确路径。但是您似乎还没有走到这一步，所以请先解决

ssh

问题

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帽子提示堆叠溢出帖子以获得灵感。

也许首先装载目录是最好的解决方案。这可以使用

sshfs

完成。理论上，您也可以使用

system（）

从R中执行mount命令。这假设使用R的浏览器界面Don正常。当我运行此代码x=scp（“140.184.134.189”、“cluster.csv”、“PASSPHRASE”、user=“Don”）时，我装入了RCurl包。我收到以下消息错误：找不到函数“scp”另外：有21个警告（使用warnings（）查看它们）您是否尝试使用commmand

install.packages（“RCurl”）

安装

RCurl

？第一次使用列表下载此软件包时，我使用了此代码，并收到了将软件包安装到“/Users/badrmansour/Library/R/3.1/Library”中的消息（由于'lib'未指定）从'pkgs'尝试URL''内容类型'application/x-gzip'长度718964字节（702 Kb）打开的URL推断'repos=NULL'，我从R站点下载这个包，我不知道我现在要做什么你能试着键入

require（“RCurl”）吗

在您的控制台中，让我们知道您看到了什么。如果没有安装RCurl，或者缺少任何依赖项，R应该输出此信息。我得到了要求（“RCurl”）加载所需包：RCurl加载所需包：bitops

x = scp("140.184.134.189", "cluster.csv", "PASSPHRASE", user="don")