使用dplyr汇总进行清点时省略NAs
我的问题涉及使用dplyr中的使用dplyr汇总进行清点时省略NAs,r,dplyr,R,Dplyr,我的问题涉及使用dplyr中的summary_each函数对具有多列(50列)的数据帧进行汇总。 列中的数据项是二进制的(0=负,1=正),我的目标是得到colsums和正百分比。 问题是有些列有NAs,我希望在计算总数和百分比时排除这些。 下面是一个简单的例子: library(dplyr) library(tidyr) df=data.frame( x1=c(1,0,0,NA,0,1,1,NA,0,1), x2=c(1,1,NA,1,1,0,NA,NA,0,1), x3=c(0,
summary_each
函数对具有多列(50列)的数据帧进行汇总。
列中的数据项是二进制的(0=负,1=正),我的目标是得到colsums和正百分比。
问题是有些列有NAs,我希望在计算总数和百分比时排除这些。
下面是一个简单的例子:
library(dplyr)
library(tidyr)
df=data.frame(
x1=c(1,0,0,NA,0,1,1,NA,0,1),
x2=c(1,1,NA,1,1,0,NA,NA,0,1),
x3=c(0,1,0,1,1,0,NA,NA,0,1),
x4=c(1,0,NA,1,0,0,NA,0,0,1),
x5=c(1,1,NA,1,1,1,NA,1,0,1))
> df
x1 x2 x3 x4 x5
1 1 1 0 1 1
2 0 1 1 0 1
3 0 NA 0 NA NA
4 NA 1 1 1 1
5 0 1 1 0 1
6 1 0 0 0 1
7 1 NA NA NA NA
8 NA NA NA 0 1
9 0 0 0 0 0
10 1 1 1 1 1
df %>%
summarise_each(funs(total.count=n(), positive.count=sum(.,na.rm=T),positive.pctg=sum(.,na.rm=T)*100/n())) %>%
gather(key,fxn,x1_total.count:x5_positive.pctg) %>%
separate(key,c("col","funcn"),sep="\\_") %>%
spread(funcn,fxn)
col positive.count positive.pctg total.count
1 x1 4 40 10
2 x2 5 50 10
3 x3 4 40 10
4 x4 3 30 10
5 x5 7 70 10
例如,我希望在上表中得到x1的总数(total.count),如下所示:
length(df$x1[!is.na(df$x1)])
[1] 8
sum(df$x1,na.rm=T)/length(df$x1[!is.na(df$x1)])
[1] 0.5
相反,我得到了以下等价物,其中包括NAs:
length(df$x1)
[1] 10
sum(df$x1,na.rm=T)/length(df$x1)
[1] 0.4
我还希望x1的百分比(正值.pctg)为:
length(df$x1[!is.na(df$x1)])
[1] 8
sum(df$x1,na.rm=T)/length(df$x1[!is.na(df$x1)])
[1] 0.5
相反,我得到了以下等价物,其中包括NAs:
length(df$x1)
[1] 10
sum(df$x1,na.rm=T)/length(df$x1)
[1] 0.4
如何在dplyr ommiting NAs中进行计数?函数n()
或length()
似乎不接受任何
像na.omit/na.rm/complete.cases这样的参数
。
如蒙协助,将不胜感激 试试看
df %>%
summarise_each(funs(total.count=sum(!is.na(.)), positive.count=sum(.,na.rm=T),positive.pctg=sum(.,na.rm=T)*100/sum(!is.na(.))))%>%
gather(key,fxn,x1_total.count:x5_positive.pctg) %>%
separate(key,c("col","funcn"),sep="\\_") %>%
spread(funcn,fxn)