R、se中的glmmPQL.fit不提供se值
对glmmPQL(R中的MASS package)返回的对象使用predict()时,我似乎无法返回标准错误。下面是我的工作流的一个典型示例,其中包含一些虚拟数据:R、se中的glmmPQL.fit不提供se值,r,glm,predict,R,Glm,Predict,对glmmPQL(R中的MASS package)返回的对象使用predict()时,我似乎无法返回标准错误。下面是我的工作流的一个典型示例,其中包含一些虚拟数据: #### simulate some representative data set.seed(1986) dep <- rbinom(200, 1, .5) # dependent binomial variable set.seed(1987) ind <- r
#### simulate some representative data
set.seed(1986)
dep <- rbinom(200, 1, .5) # dependent binomial variable
set.seed(1987)
ind <- rnorm(200) # Gaussian independent variable
set.seed(1988)
ran <- rep(1:5, 40) # random factor
##### use PQL to run binomial GLMM
anTest <- glmmPQL(dep~ind, random=~1|ran, family=binomial)
##### specify values of *ind* at which to predict. expand.grid() is overkill here...
newData <- expand.grid(ind=seq(min(ind), max(ind), length.out=100))
#### and generate predictions
pred <- predict(anTest, newdata=newData, type="response", level=0, se.fit=TRUE)
(newData <- data.frame(newData, fit=pred))
模拟一些有代表性的数据
种子集(1986)
dep在
predict.glmmPQL
中没有se.fit
参数。我知道了……BradleyTerry2包似乎有一个predict.glmmPQL,它有se.fit,但这个包似乎不起作用。关于如何实现预测置信度的估计,还有其他想法吗?对于混合效应模型来说,这实际上是一个难题。你需要做些调查。