正在工作的R脚本代码未在Markdown中工作-RStudio挂起

有人能帮助我理解有效的r脚本代码是如何导致rStudio中的标记文档挂起并变得无响应，直到我必须终止会话和IDE吗？也没有编制任何文件

背景：

• 在两台不同的机器上试用，运行最新的rStudio版本 Windows 7和Windows 10上的0.99.489和R 3.2.2（64位）
• 尝试使用packrat管理包
• 尝试从项目目录中加载形状文件
• 尝试从spdep项目下载加载其他形状文件
• 再次尝试重新安装程序包

R脚本 获取所需的库并加载它们

#Install the GIS packages
install.packages("spdep",dependencies = TRUE)
install.packages("maptools",dependencies = TRUE)
#Load the libraries
library(spdep)
library(maptools)

这在R中起作用（您需要在系统上获得形状文件的正确位置）

#查看库文件的存储位置
.libPaths（）
#使用maptools中的readShapePoly函数加载spdep包中的Eire形状文件（需要将windows中的斜杠更改为R中支持的斜杠）
eireMap这将允许您在重新安装包之前检查包（并且在加载包时不显示任何消息）。然后，它使用跨平台的方式获取所需的shapefile的文件名，然后读取并打印它。单独的R代码行（即非Rmd）在R控制台和RStudio+中工作良好，Rmd在我的OS X系统和linux系统上工作良好。有更优雅的方法来检查/加载包，但这将让您快速检查系统上是否存在更大的问题

---
output: html_document
---

```{r echo=FALSE, message=FALSE}
if (!require(spdep)) install.packages("spdep",dependencies=TRUE)
if (!require(maptools)) install.packages("maptools",dependencies=TRUE)
require(spdep)
require(maptools)
```

```{r}
eire_shp <- system.file("etc/shapes/eire.shp", package="spdep")

eireMap <- readShapePoly(eire_shp, ID="names", 
                         proj4string=CRS("+proj=utm +zone=30 +units=km"))
```

```{r}
plot(eireMap)
names(eireMap)
eireMap$names
```

---
输出：html\u文档
---
```{r echo=FALSE，message=FALSE}
如果（！require（spdep））安装.packages（“spdep”，dependencies=TRUE）
如果（！require（maptools））安装.packages（“maptools”，dependencies=TRUE）
需要（spdep）
需要（地图工具）
```
```{r}
eire_shp创建“eireMap”的代码行似乎不同，这是故意的吗？FWIW
system.file（“etc/shapes/eire.shp”，package=“spdep”）
是获取该形状文件的正确方法。还有，你为什么每次编织时都要强制重新安装包装？谢谢，你的方式更干净，但更重要的是，它可以在降价中起作用
---
title: "GIS using R"
author: "Me"
date: "18 November 2015"
output: word_document
---

This is an R Markdown document of the R worksheet for GIS. Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code contained in that snippet

```{r, echo=FALSE}
#Install the packages if not done already
install.packages("spdep",dependencies = TRUE)
install.packages("maptools",dependencies = TRUE)
```

Load the libraries 
```{r, echo=FALSE}
library(spdep)
library(maptools)
```


See where the library files are stored
```{r}
.libPaths() 
```

Try to Load the Eire shape file but it causes R Studio to hang and become unresponsive 
```{r}
eireMap <- readShapePoly("C:R/win-  library/3.2/spdep/etc/shapes/eire.shp"[1],ID="names", proj4string=CRS("+proj=utm +zone=30 +units=km"))
```

Can't plot the map because the system has hung by this stage
```{r}
plot(eireMap)
names(eireMap)
eireMap $names
```

---
output: html_document
---

```{r echo=FALSE, message=FALSE}
if (!require(spdep)) install.packages("spdep",dependencies=TRUE)
if (!require(maptools)) install.packages("maptools",dependencies=TRUE)
require(spdep)
require(maptools)
```

```{r}
eire_shp <- system.file("etc/shapes/eire.shp", package="spdep")

eireMap <- readShapePoly(eire_shp, ID="names", 
                         proj4string=CRS("+proj=utm +zone=30 +units=km"))
```

```{r}
plot(eireMap)
names(eireMap)
eireMap$names
```