使用R中三位数的多输入算法在多个文件上循环

我正在使用一个叫做SAIGE-GENE的基因解释软件。算法如下所示（完整算法）：它涉及多个不同的文件，文件名中有染色体编号（1到22）

我没有把整件事都放在这里，因为它不相关。我在这个算法中输入了一些不同的文件，通常我把我的文件命名为chr1\u file\u name.txt…chr22\u file\u name.txt

然后，我在整个算法中使用R中的for循环，使用粘贴函数按染色体编号输入不同的文件名：

for(i in 1:22){SPAGMMATtest = function(
         vcfFile = paste("chr",i,"_file_name.txt", sep=""),
                 vcfFileIndex = "",
         vcfField = "DS",
         savFile = "",
         groupFile ="paste("chr",i,".group_file.txt", sep="")",

等

这很好，但是，我认为我会很聪明，在这个实验中使用三位数的文件名命名：chr001_file_name.txt…chr022_file_name.txt

我以前的循环现在不工作，如果我将循环的开始更改为for（001:022中的I），它也不工作

我做错了什么？如何在不重命名所有文件的情况下修复此问题？

建议

尝试：

vcfile=paste（“chr”，sprintf（“%03d”，i），“\u file\u name.txt”，sep=”“）

，编辑：对于较短的代码，可以使用

paste0（）

，并删除sep参数

为了创建包含3位数字和前导零的字符文件名，例如001、002、…、022

通过完全使用

sprintf（）

创建文件名，从而删除对

paste（）

或

paste0（）

的调用，可以进一步缩短文件名：

---

使用

我尝试：
vcfile=paste（“chr”，sprintf（“%03d”，i），“\u file\u name.txt”，sep=”“），
edit：对于较短的代码，可以使用
paste0（）
，并删除sep参数……感谢Wimpel，我认为它起作用了（运行需要很长时间！）。那么，你在循环中坚持（我在1:22）吗？“%03d”是指一个零，然后i总共是3位数字吗？
%03d
是指：转换为三位数字，需要时添加前导零。。因此1变为001，21变为021，201变为201。亲爱的@Uwe，非常感谢您花时间完善代码和有用的解释。多亏了你们的努力，我学到了很多关于sprintf的实用性和更有效地调用循环的知识。
for(i in 1:22){SPAGMMATtest = function(
         vcfFile = paste("chr",i,"_file_name.txt", sep=""),
                 vcfFileIndex = "",
         vcfField = "DS",
         savFile = "",
         groupFile ="paste("chr",i,".group_file.txt", sep="")",

sprintf("chr%03d_file_name.txt", i)

for(i in 1:22){SPAGMMATtest = function(
         vcfFile = paste("chr",i,"_file_name.txt", sep=""),
                 vcfFileIndex = "",
         vcfField = "DS",
         savFile = "",
         groupFile ="paste("chr",i,".group_file.txt", sep="")",
         ...

for (i in 1:22) {
     SPAGMMATtest(
         vcfFile = sprintf("chr%03d_file_name.txt", i),
         vcfFileIndex = "",
         vcfField = "DS",
         savFile = "",
         groupFile = sprintf("chr%03d.group_file.txt", i)
         ...