从r中的多个列表生成二进制(存在/不存在)数据矩阵
我有一系列不同长度的独立变量列表(字符串)。我想将它们合并到一个数据帧中,以形成存在(1)/不存在(0)矩阵。考虑到它们的长度不同,我甚至不知道如何创建初始数据帧。以下是我的例子:从r中的多个列表生成二进制(存在/不存在)数据矩阵,r,dataframe,matrix,binary,heatmap,R,Dataframe,Matrix,Binary,Heatmap,我有一系列不同长度的独立变量列表(字符串)。我想将它们合并到一个数据帧中,以形成存在(1)/不存在(0)矩阵。考虑到它们的长度不同,我甚至不知道如何创建初始数据帧。以下是我的例子: data1 <- c("a", "b", "c", "d", "e", "f") data2 <- c("e", "f", "g") data3 <- c("a", "c", "g") 我还是新手,希望我的解释可以。谢谢您的帮助。在splitstackshape包中有一个名为charMat的帮助函
data1 <- c("a", "b", "c", "d", "e", "f")
data2 <- c("e", "f", "g")
data3 <- c("a", "c", "g")
我还是新手,希望我的解释可以。谢谢您的帮助。在
splitstackshape
包中有一个名为charMat
的帮助函数,您可能想尝试一下
dat <- paste0("data", 1:3)
out <- t(splitstackshape:::charMat(listOfValues = mget(dat), fill = 0L))
colnames(out) <- dat
out
# data1 data2 data3
#a 1 0 1
#b 1 0 0
#c 1 0 1
#d 1 0 0
#e 1 1 0
#f 1 1 0
#g 0 1 1
其中,dat
是包含输入数据名称的字符向量
dat
#[1] "data1" "data2" "data3"
t
用于转置charMat
的输出
希望这有帮助。我会这样做,使用%中的
%返回一个逻辑向量,如果有值或没有值。稍后,我们使用as.integer
将逻辑值转换为0和1
# create a master list
master_list <- unique(c(data1, data2, data3))
# make sure each list is as long as master to avoid,
# this error : longer object length is not a multiple of shorter object length
# adding 'll' just a random value
data1 <- c(data1, rep('ll', length(master_list) - length(data1)))
data2 <- c(data2, rep('ll', length(master_list) - length(data2)))
data3 <- c(data3, rep('ll', length(master_list) - length(data3)))
# create output matrix
mat <- matrix(c(as.integer(master_list %in% data1),
as.integer(master_list %in% data2),
as.integer(master_list %in% data3)),
nrow = length(master_list),
dimnames = list(master_list))
[,1] [,2] [,3]
a 1 0 1
b 1 0 0
c 1 0 1
d 1 0 0
e 1 1 0
f 1 1 0
g 0 1 1
#创建主列表
师父,谢谢。我无法让它工作,因为它创建了一个包含一列和行数data1+data2+data3的矩阵。另外,这是一个示例,我有25个列表,所以手工编码每个列表似乎不是一个理想的解决方案。。
mget(dat)
#$data1
#[1] "a" "b" "c" "d" "e" "f"
#$data2
#[1] "e" "f" "g"
#$data3
#[1] "a" "c" "g"
dat
#[1] "data1" "data2" "data3"
# create a master list
master_list <- unique(c(data1, data2, data3))
# make sure each list is as long as master to avoid,
# this error : longer object length is not a multiple of shorter object length
# adding 'll' just a random value
data1 <- c(data1, rep('ll', length(master_list) - length(data1)))
data2 <- c(data2, rep('ll', length(master_list) - length(data2)))
data3 <- c(data3, rep('ll', length(master_list) - length(data3)))
# create output matrix
mat <- matrix(c(as.integer(master_list %in% data1),
as.integer(master_list %in% data2),
as.integer(master_list %in% data3)),
nrow = length(master_list),
dimnames = list(master_list))
[,1] [,2] [,3]
a 1 0 1
b 1 0 0
c 1 0 1
d 1 0 0
e 1 1 0
f 1 1 0
g 0 1 1