从Rstudio中获取caret包工作的train（）函数是否有任何变通方法？

我正在浏览Max Kuhn和Kjell Johnson写的非常好的书《应用预测建模》的示例，不幸的是，我被困在使用

train（）的一个示例中

函数和

GermanCredit

数据集之一，该数据集由

caret

软件包提供，用于支持向量机的交叉验证：

library(AppliedPredictiveModeling)
library(caret)
# preparing the data
data(GermanCredit)
GermanCredit <- GermanCredit[, -nearZeroVar(GermanCredit)]
GermanCredit$CheckingAccountStatus.lt.0 <- NULL
GermanCredit$SavingsAccountBonds.lt.100 <- NULL
GermanCredit$EmploymentDuration.lt.1 <- NULL
GermanCredit$EmploymentDuration.Unemployed <- NULL
GermanCredit$Personal.Male.Married.Widowed <- NULL
GermanCredit$Property.Unknown <- NULL
GermanCredit$Housing.ForFree <- NULL
set.seed(100)
inTrain <- createDataPartition(GermanCredit$Class, p = .8)[[1]]
GermanCreditTrain <- GermanCredit[ inTrain, ]
GermanCreditTest  <- GermanCredit[-inTrain, ]

# Grid selection for `sigma` and `cost` tuning parameters:    
library(kernlab)
set.seed(231)
sigDist <- sigest(Class ~ ., data = GermanCreditTrain, frac = 1)
svmTuneGrid <- data.frame(.sigma = sigDist[1], .C = 2^(-2:7))

# SVM classification and cross-validation
svmFit <- train(Class ~ .,
                data = GermanCreditTrain,
                method = "svmRadial",
                preProc = c("center", "scale"),
                tuneGrid = svmTuneGrid,
                trControl = trainControl(method = "repeatedcv", repeats = 5, 
                                         classProbs =  TRUE))  

有时会显示以下错误消息：

Loading required package: class
Warning: namespace ‘compiler’ is not available and has been replaced
by .GlobalEnv when processing object ‘GermanCredit’
Error in comp(expr, env = envir, options = list(suppressUndefined = TRUE)) : 
  could not find function "makeCenv"
In addition: Warning message:
executing %dopar% sequentially: no parallel backend registered

然后我了解到

makeCenv（）

在

doMC

包中，该包被建议作为并行计算或并行处理的替代方案，但我不会选择此包，因为我想它在Windows平台中不可用。还有别的选择吗

更新： 这些错误只有在代码在

rstudioide

下运行时才会出现，默认的R控制台没有问题，所以我想问题是Rstudio的局部问题。在R控制台中的时间有点长（大约8分钟），不过，考虑到下面提到的硬件规格，我想知道如何加快速度

我的sessioninfo（）输出在这里（Rstudio）：

默认R控制台的sessionInfo（）输出：

R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] datasets  grDevices grid      splines   graphics  utils     stats    
[8] methods   base     

other attached packages:
 [1] e1071_1.6-1     class_7.3-9     kernlab_0.9-19  caret_5.17-7   
 [5] foreach_1.4.1   cluster_1.14.4  lattice_0.20-23 reshape2_1.2.2 
 [9] plyr_1.8        scales_0.2.3    ggplot2_0.9.3.1 lmPerm_1.1-2   
[13] coin_1.0-23     survival_2.37-4 sos_1.3-8       brew_1.0-6     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] codetools_0.2-8    colorspace_1.2-4   compiler_3.0.2     dichromat_2.0-0   
 [5] digest_0.6.3       gtable_0.1.2       iterators_1.0.6    labeling_0.2      
 [9] MASS_7.3-29        modeltools_0.2-21  munsell_0.4.2      mvtnorm_0.9-9996  
[13] proto_0.3-10       RColorBrewer_1.0-5 stats4_3.0.2       stringr_0.6.2     
[17] tools_3.0.2       

问题：

必须与

Rstudio

进行交互，因为它在默认的R控制台中运行良好，基于默认的R控制台和Rstudio的两个sessionInfo（）输出，区别在于

编译器

包。奇怪的是，这个包裹在CRAN里找不到，我在这里找到了一张便条： 当我在Rstudio中执行此操作时，表示load（编译器）就足够了：不可能出现以下错误消息：

错误：程序包“编译器”是在R 3.0.0之前生成的：请重新安装它

更新
在将编译器包库从默认R lib路径复制粘贴到Rstudio lib路径后，使用Rstudio最终奏效，但时间仍然太长（大约8分钟），如果这有助于更快找到答案，我将发布一个单独的并行处理问题，给出下面的硬件和windows

我的笔记本电脑是2.1GHz双核处理器，3GB，windows 32位，你知道如何使用

train（）

函数进行并行处理吗？你能不能给我发个R码，我真的非常感激

---

插入符号代码库完全独立于doMC或任何其他“do”包。我没有一个windows系统在这里测试，但我99%肯定这不是一个重复的问题。该软件包每晚在多个地方（如R-Forge）和3-4个不同操作系统（包括Windows）进行测试。我从来没有见过这个问题出现，甚至当我专门使用Windows向大量观众讲授这个软件包的课程时

我的猜测是您意外地在某处调用了一个doMC函数（即使它没有列在您的sessionInfo输出中）

如果其他人可以尝试重现此错误，这将很有帮助

谢谢

最大值

升级R

    sudo su
    echo "deb http://www.stats.bris.ac.uk/R/bin/linux/ubuntu precise/" >> /etc/apt/sources.list
    apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9
    apt-get update
    apt-get upgrade

---

这不可能是因为调用了

doMC

其他地方，我会排除这个。错误消息一直指向

makeCenv（）

，但这次

命名空间“编译器”不可用

，请查看上面的更新错误消息。我希望有一个补救办法。它最终起作用了，但只有在默认的R控制台中没有任何错误，完成这项工作需要几分钟，因此必须与Rstudio进行交互，我更新了问题。我想知道如何在Windows 32位下设置并行处理，我的笔记本电脑是双核2.1GHz，RAM 3GB。我注意到默认R控制台和Rstudio的两个SessionInfo（）之间的区别是错误消息中出现的编译器包，无法使用R studio加载此程序包

错误：程序包“compiler”是在R 3.0.0之前生成的：请重新安装它
。是的，我安装了
compiler_3.0.2
版本，因为无法从CRAN下载复制和粘贴，因此它工作正常。似乎这个包已经随R一起提供了，但是由于某种原因，我在Rstudio lib路径中有一个旧版本，这引起了所有的麻烦。
R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] datasets  grDevices grid      splines   graphics  utils     stats    
[8] methods   base     

other attached packages:
 [1] e1071_1.6-1     class_7.3-9     kernlab_0.9-19  caret_5.17-7   
 [5] foreach_1.4.1   cluster_1.14.4  lattice_0.20-23 reshape2_1.2.2 
 [9] plyr_1.8        scales_0.2.3    ggplot2_0.9.3.1 lmPerm_1.1-2   
[13] coin_1.0-23     survival_2.37-4 sos_1.3-8       brew_1.0-6     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] codetools_0.2-8    colorspace_1.2-4   compiler_3.0.2     dichromat_2.0-0   
 [5] digest_0.6.3       gtable_0.1.2       iterators_1.0.6    labeling_0.2      
 [9] MASS_7.3-29        modeltools_0.2-21  munsell_0.4.2      mvtnorm_0.9-9996  
[13] proto_0.3-10       RColorBrewer_1.0-5 stats4_3.0.2       stringr_0.6.2     
[17] tools_3.0.2       

    sudo su
    echo "deb http://www.stats.bris.ac.uk/R/bin/linux/ubuntu precise/" >> /etc/apt/sources.list
    apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9
    apt-get update
    apt-get upgrade